[发明专利]一种与苹果柱状树形基因紧密连锁的分子标记及应用

说明书

本发明公开了一种与苹果柱状树形基因紧密连锁的分子标记及应用，利用本发明中的分子标记引物，可在幼苗期时对柱型与普通型苹果的杂交群体后代中进行分子标记的辅助选择，能够有效的克服1～2年生的柱状苹果杂交群体后代中柱状苹果树与普通型苹果树在幼苗期形态学不易鉴定的缺点，并且这种方法快速，简单，准确，可以在一定程度上提高育种效率，加速育种工作的进程。

技术领域

本发明属于分子标记技术领域，具体涉及一种与苹果柱状树形基因紧密连锁的分子标记及应用。

背景技术

柱状树形是苹果育种上可利用的一个优良性状，具有这种优良性状的苹果称为柱状苹果，其具有特异的生长习性，主要表现为节间短，短枝多，侧枝少，植株整体呈自然单干形，这既不同于普通型，也不同于短枝型和矮化型，而这种树形紧凑且修剪量小的植株非常适合高度密植和机械化管理。但在育种实践中，柱状苹果树与普通型苹果树在幼苗期时不易区分，实生苹果苗栽植后需要2～3年的时间才能从形态学上区分，一般费时费力。利用遗传标记进行辅助选择可以极大的提高选择效率，减少育种过程时间和成本以及育种过程中的盲目性。

公开号为CN106191276A的中国专利公开了一种利用分子标记快速区分柱状苹果苗木的方法，该专利以两对寡聚脱氧核糖核普酸序列作为引物对，同时对与柱状基因相连锁的分子标记进行扩增，对引物的扩增产物电泳结果中至少有一对引物有所述分子标记对应的特异条带的，则说明对应的苹果苗木为柱状苹果；两对引物的扩增产物电泳结果均无对应的特异条带的，则为普通型苹果。在此基础上，发明人进一步进行研究，发现与苹果柱状树形基因相连锁的分子标记不止上述两个，发明人还发现了其它与之相关的分子标记，更加有利于柱状树形苹果分子标记辅助育种体系的建立，为柱状苹果的育种分子学育种打下基础。

发明内容

本发明的目的之一在于提供一种与苹果柱状树形基因紧密连锁的分子标记及引物对。

本发明的目的之二在于提供上述与苹果柱状树形基因紧密连锁的分子标记的应用。

为实现上述目的，本发明采取如下技术方案：

本发明公开了一种与苹果柱状树形基因紧密连锁的分子标记，所述分子标记C6536-31519引物对的脱氧核糖核苷酸序列为：

C6536-31519-F：TGGATGGTGGGATTTCTTGT

C6536-31519-R：AAGGAAACCACATTGCCAAA。

本发明还公开了上述分子标记的检测方法，利用分子标记C6536-31519引物对以被检测苹果基因组DNA为模板进行扩增，如果能扩增出如Seq ID No.1所示的196bp DNA片段，即可判断为该苹果为柱状苹果。具有果柱状树型的苹果包括但不限于以下品种：润太一号’、‘舞佳’、‘舞姿’和‘舞美’。

本发明还公开了上述分子标记引物对在苹果柱状树型辅助育种中的用途。也就是说本发明的分子标记可用于今后的分子标记辅助育种中，本领域技术人员可以理解，比如通过检测是否存在本发明的分子标记来筛选柱状苹果。所述检测可以是PCR检测的方法，具体地，可以使用上述的本发明的分子标记的引物对，所述检测还可以通过测序方法进行。

本发明还保护含有上述分子标记C6536-31519引物对的鉴定柱型苹果的试剂盒，该试剂盒可以用于对品种的检测。

另外，上述分子标记还可以对苹果柱状树形相关的基因进行定位或检测。这些应用均可以按照常规的方法进行。

本发明具有如下优点：

本发明在已经公开的柱状苹果分子标记基础上，又发现了新的分子标记，更加有利于柱状树形苹果分子标记辅助育种体系的建立，为柱状苹果的育种分子学育种打下基础。