[发明专利]COVID-19数据采集分析系统在审
申请号: | 202010517157.7 | 申请日: | 2020-06-09 |
公开(公告)号: | CN111681727A | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | 陈翔;陈先来;王科;黄志军;沈敏学 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | G16H10/60 | 分类号: | G16H10/60;G16H50/70;G16H70/60;G06N20/00;G06F16/25 |
代理公司: | 湖南科云知识产权代理事务所(普通合伙) 43253 | 代理人: | 黄美成 |
地址: | 410083 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | covid 19 数据 采集 分析 系统 | ||
1.一种COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,该系统包括数据采集系统和数据分析系统;
所述数据采集系统用于从医院信息系统(HIS)、检验科信息系统(LIS)、医学影像信息系统(PACS)和疾病预防控制系统中采集患者的治疗方案、用药数据、检验数据、检查数据、影像数据和流行病学数据,采集的数据根据患者身份证号码或病人标识号进行关联;
所述数据分析系统与数据采集系统连接,数据分析系统用于对采集的数据进行缺失值处理和分类型转化,并进行数据分析和结果可视化。
2.根据权利要求1所述的COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,所述COVID-19数据采集分析系统还包括结果显示模块,结果显示模块与数据分析系统连接,用于显示数据分析系统的结果。
3.根据权利要求1或2所述的COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,所述数据采集系统通过VPN网络,从HIS系统采集患者的治疗方案、用药数据;从LIS系统采集患者的检验数据、检查数据;从PACS系统采集患者的影像数据;从疾病预防控制系统采集患者的流行病学数据。
4.根据权利要求1或2所述的COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,所述数据采集系统包括模板管理单元、数据源管理单元、数据检验单元和手工录入编辑单元;
所述模板管理单元包括映射构建模块、模板拆分模块,映射构建模块用于构建COVID-19数据映射模板,利用该数据映射模板,实现HIS数据、LIS数据、PACS数据和疾病预防控制系统数据的规范化映射处理;模板拆分模块用于将数据映射模板拆分成多个具有业务关联的数据模型,即治疗方案模型、用药数据模型、检验数据模型、检查数据模型、影像数据模型和流行病学数据模型,并生成针对每个数据模型的数据采集SQL脚本;
所述数据源管理单元用于记录并存储数据采集过程中访问的不同医院管理系统中的配置信息,包括数据源驱动文件、数据库名称、URL和登录信息配置,同时为数据采集提供既有医疗数据源配置的连通支持;
所述数据检验单元包括数据执行模块、数据校验模块,数据执行模块用于实现基于数据模型采集过程的模拟运行并显示运行结果集,获得符合数据模型标准的数据信息;数据校验模块用于数据采集过程中数据的合规性校验,对不符合标准数据进行异常提示;
所述手工录入编辑单元使用人工录入的方式,编辑数据映射模板中的缺失数据项。
5.根据权利要求1或2所述的COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,所述数据分析系统包括数据融合与预处理模块、机器学习算法模块,通过数据融合与预处理模块进行缺失值处理和分类型数据转化;通过机器学习算法模块进行数据分析和结果可视化。
6.根据权利要求5所述的COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,所述数据融合与预处理模块根据病人身份证号或者病人标识号,把疾病预防控制系统数据与HIS数据、LIS数据、PACS数据进行连接融合,对于融合数据后的每个病人,计算该病人所有数据项的缺失率,对缺失率超过阈值的病人及其对应数据进行剔除,对未超过阈值的缺失特征进行数据特征补全。
7.根据权利要求5所述的COVID-19数据采集分析系统,其特征在于,所述机器学习算法模块预设多个机器学习算法,将机器学习算法封装成函数形式,由用户自行选择机器学习算法并设定算法参数,机器学习算法模块接收数据融合与预处理模块输出的数据表,将数据表转换为dataframe格式数据,并将dataframe格式数据和用户设定算法参数共同作为用户选择函数的输入,完成数据分析,最终以图表形式对分析结果进行可视化展示。
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