[发明专利]用于多花黄精块茎基因表达分析的内参基因组合及其应用有效
申请号: | 202010535853.0 | 申请日: | 2020-06-12 |
公开(公告)号: | CN111690762B | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
发明(设计)人: | 李海波;杨阳;沈建军;叶碧欢;陈友吾;宋其岩;胡传久 | 申请(专利权)人: | 浙江省林业科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人: | 冷红梅 |
地址: | 310023 *** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 花黄 块茎 基因 表达 分析 内参 组合 及其 应用 | ||
1.用于不同发育时期多花黄精块茎基因表达分析的引物组合,包括:
上游引物:5'-CCTCGGCACACCTCTATGAT-3'
下游引物:5'-TAGGAATGGCAGGGTGAAAC-3'
SQLE基因:
上游引物:5'-GAAAGGATGGACGCCAAGTA-3'
下游引物:5'-CCTCCCAGCAACATCTGAAT-3'
SMO1基因:
上游引物:5'-GTCCAACTTGCCACTGGTTT-3'
下游引物:5'-GCGGACAGAGCCAGAGTAAC-3'
DWF5基因:
上游引物:5'-GCTTTTCCCCAGATCAAACA-3'
下游引物:5'-TTCTCCCGGGATGTATCTTG-3'
DWF1基因:
上游引物:5'-GGCTTCGAGAACAACCTGAC-3'
下游引物:5'-GTGGTTACGGATCAGCCAGT-3'
CYP710A基因:
上游引物:5'-CAGCTGGGGTGTTGATCTTT-3'
下游引物:5'-GCCCTGTTGCTTAGATCTCG-3'
内参UBQ-E2-10:
上游:5'-GGACCCAGAAGTACGCAATG-3'
下游:5'-AATTACCAGGGATACAGCACC-3'
内参EF-1α2:
上游:5'-CCCTTCTTGACGCTCTTGAC-3'
下游:5'-GAGCTTCATGGTGCATCTCA-3'。
2.一种不同发育时期多花黄精块茎基因表达分析的方法,所述方法包括:针对不同发育时期多花黄精块茎中甾体皂苷生物合成通路中相关目的基因FDFT1、SQLE、SMO1、DWF5、DWF1和CYP710A分别设计特异性扩增引物,并根据内参基因UBQ-E2-1和EF-1α2特征序列设计特异性扩增引物,采用上述引物分别以多花黄精块茎为实验材料进行扩增,根据目的基因和内参基因的CT值计算相对表达量,所述特异性扩增引物序列如下:
FDFT1基因:
上游引物:5'-CCTCGGCACACCTCTATGAT-3'
下游引物:5'-TAGGAATGGCAGGGTGAAAC-3'
SQLE基因:
上游引物:5'-GAAAGGATGGACGCCAAGTA-3'
下游引物:5'-CCTCCCAGCAACATCTGAAT-3'
SMO1基因:
上游引物:5'-GTCCAACTTGCCACTGGTTT-3'
下游引物:5'-GCGGACAGAGCCAGAGTAAC-3'
DWF5基因:
上游引物:5'-GCTTTTCCCCAGATCAAACA-3'
下游引物:5'-TTCTCCCGGGATGTATCTTG-3'
DWF1基因:
上游引物:5'-GGCTTCGAGAACAACCTGAC-3'
下游引物:5'-GTGGTTACGGATCAGCCAGT-3'
CYP710A基因:
上游引物:5'-CAGCTGGGGTGTTGATCTTT-3'
下游引物:5'-GCCCTGTTGCTTAGATCTCG-3'
内参UBQ-E2-10:
上游:5'-GGACCCAGAAGTACGCAATG-3'
下游:5'-AATTACCAGGGATACAGCACC-3'
内参EF-1α2:
上游:5'-CCCTTCTTGACGCTCTTGAC-3'
下游:5'-GAGCTTCATGGTGCATCTCA-3'。
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