[发明专利]一种豇豆InDel分子标记检测引物组及试剂盒

说明书

本发明公开了一组豇豆InDel分子标记及引物组，所述InDel分子标记均匀分布于11条染色体上，具有数量丰富、遗传稳定、重复性好、多态性高的特点，序列如SEQ ID NO.1～170所示。本发明还提供了上述InDel分子标记的试剂盒与检测方法，该方法简捷，成功率高，且能避免了由于特异性和复杂性导致的后续分析模糊的问题，拥有广泛的应用前景。

技术领域

本发明属于植物分子标记技术领域，具体涉及一种豇豆InDel分子标记检测试剂盒及引物组。

背景技术

豇豆(Vigna unguiculata.)又名豆角、饭豆、泼豇豆等，属豆科(Leguminosae)蝶形花亚科(papilionoideae)豇豆属植物，起源于非洲，是全球范围内最重要的豆类作物之一。

分子标记RAPD、SSR、SNP等广泛地应用于豇豆种质资源遗传多样性评价、遗传图谱的构建与基因定位、分子标记辅助育种等方面。随着现代生物学理论与技术的不断发展进步，特别是18年首次发布了豇豆基因组信息，近年来豇豆DNA分子水平上的研究愈来愈成为学者们关注的焦点和热点。

目前豇豆DNA分子标记仍需要大量的开发并应用，尤其是在高密度分子遗传连锁图谱的构建，与生物逆境(虫害、病害等)、非生物逆境(高温、干旱、盐碱、湿涝等)以及与正常发育相关的功能基因鉴定与发掘。为有效拓宽豇豆的遗传基础、加快不同育种目标下的豇豆新品种选育及遗传改良进程，分子标记辅助选择育种方法是有效可行的。

插入/缺失(insertion-deletion，InDel)是指在近缘种或同一物种不同个体之间基因组同一位点的序列发生了不同大小核苷酸片段的插入或缺失，即一个序列上某一位点相比同源的另一个序列插入或缺失了一个或多个碱基。InDel标记属于共显性标记，具有较好的稳定性和较为丰富的多态性，已广泛应用于玉米，水稻，茄子，黄瓜等作物分子标记辅助育种中，并且取得了较大的进展，然而在豇豆遗传育种研究方面却没有相关的报道。

通过设计开发一批高质量的豇豆InDel标记，可为豇豆种质资源的合理开发利用以及进一步开展豇豆育种研究、指导亲本选配提供依据；同时可为豇豆种质的分类、核心种质库的构建，最终为豇豆种质资源的进一步收集保存、利用提供分子水平上的依据，缩短育种年限，提高育种效率。因此，开发出一组高质量的豇豆InDel标记，无论在遗传学基础理论研究还是在实际育种应用上都具有较大的科学意义与应用前景。

发明内容

本发明第一个方面的目的，在于提供一组高质量的豇豆InDel分子标记检测引物组。

本发明第二个方面的目的，在于提供一种豇豆InDel分子标记检测试剂盒。

本发明第三个方面的目的，在于提供一种豇豆InDel分子标记的检测方法。

本发明第四个方面的目的，在于提供上述引物组或上述试剂盒在基因分型、遗传图谱构建中的应用。

本发明第五个方面的目的，在于提供上述引物组或上述试剂盒在基因定位中的应用。

本发明第六个方面的目的，在于提供上述引物组或上述试剂盒在分子辅助育种中的应用。

本发明第七个方面的目的，在于提供上述引物组或上述试剂盒在种质资源鉴定评、遗传多样性分析中的应用。

本发明第八个方面的目的，在于提供上述引物组或上述试剂盒在种子纯度、杂交种鉴定中的应用。

本发明所采取的技术方案是：

本发明的第一个方面，提供一组豇豆InDel分子标记检测引物组，包括检测表3所示InDel分子标记位点的特异性引物。

根据本发明第一个方面所述的引物组，所述引物组包括SEQ ID NO.1～170所示的特异性引物。