[发明专利]一种参与脂质代谢的新型化合物及其制备方法

说明书

本发明提供了一种新型的化合物，所述化合物为E‑13‑(2‑甲基苯基)‑12‑烯‑十三酸，上述化合物来源于球孢链霉菌C‑1027，其能够影响细胞对于低密度脂蛋白的摄取，参与了胞内的脂质代谢过程。上述化合物为白色无定形粉末，难溶于水，易溶于丙酮、氯仿等低极性有机溶剂。本发明还提供了利用调控蛋白SGL6295和调控蛋白SGL6296制备上述化合物的方法。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种化合物及其制备方法和应用，尤其涉及一种 新型的参与脂质代谢的化合物及其制备方法。

背景技术

微生物的次级代谢产物是药物发现的重要来源，链霉菌产生的次级代谢产物具有广泛 的生物活性，超过三分之二的临床有用抗生素是从链霉菌中分离出来的。传统的天然产物 发现方法存在化合物重复发现率高和新结构天然产物的发现率低等缺点。随着基因测序成 本的降低和生物信息学技术的发展，科学家们发现微生物中仍存在大量未知的生物合成基 因簇(biosynthetic gene clusters,BGCs)，具有巨大的开发潜力。但由于大多数天然产物BGCs 在实验室培养条件下不表达或表达量很低，只有在特殊的环境下才会被活化并表达出相应 的产物，因此目前发现微生物次级代谢产物方法的瓶颈之一是如何激活沉默BGCs。

球孢链霉菌C-1027(Streptomyces globisporus C-1027)是从湖北省潜江县的土壤中分 离到的一株链霉菌，能产生具有抗肿瘤活性的新型烯二炔类抗生素-力达霉素(又名C-1027)。 申请人经过十几年的研究，已经初步阐明了力达霉素的生物合成途径和调控机制，并获得 了该菌株完整的基因组序列。在此基础上，申请人拟采用基因组发掘技术对该菌株中的其 他次级代谢产物开展研究，采用过表达基因簇内部或附近可能的途径特异性调控因子的方 法激活沉默BGCs，并结合生物信息学分析、化学分离以及代谢网络分析等确定目标基因簇 的产物。

本申请中，申请人结合基因组发掘技术和转录组测序，确定S.globisporus C-1027中的 沉默生物合成基因簇，然后采用过表达基因簇内部或附近可能的途径特异性调控蛋白的策 略诱导激活，并从基因簇激活的菌株中分离鉴定新的天然产物。

发明内容

一方面，本发明提供了一种新型的化合物E-13-(2-甲基苯基)-12-烯-十三酸，所述化合 物的结构式如式I所示：

所述化合物参与了细胞的脂质代谢。

上述化合物来源于球孢链霉菌C-1027(Streptomyces globisporus C-1027)，其能够影响 细胞对于低密度脂蛋白的摄取，参与了胞内的脂质代谢过程。

上述化合物为白色无定形粉末，难溶于水，易溶于丙酮、氯仿等低极性有机溶剂。

上述化合物的¹H和¹³C NMR数据如表1-2，其ESI-MS/MS、HRMS、¹H-NMR、¹³C-NMR、 ¹H-¹H COSY、HSQC、HMBC图谱如图5-12所示。

本发明中，上述化合物，E-13-(2-甲基苯基)-12-烯-十三酸，也用化合物1来指代。

另一方面，本发明提供了一种蛋白组合，所述蛋白组合包括调控蛋白SGL6295和调控 蛋白SGL6296，其中，所述SGL6295的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示，所述SGL6296 的氨基酸序列如SEQ ID No.3所示。

本发明还提供了一种核酸构建体，所述构建体包括第一核酸序列和第二核酸序列，其 中，所述第一核酸序列编码调控蛋白SGL6295，所述第二核酸序列编码调控蛋白SGL6296。