[发明专利]食管癌基因甲基化检测引物探针组合及其试剂盒与应用有效

专利信息
申请号: 202010561492.7 申请日: 2020-06-18
公开(公告)号: CN111534600B 公开(公告)日: 2023-07-21
发明(设计)人: 邵琦;张艳桥 申请(专利权)人: 广州达健生物科技有限公司;安徽达健医学科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 陈欢
地址: 510000 广东省广州市黄埔区国际生物岛螺旋大道*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 食管癌 基因 甲基化 检测 引物 探针 组合 及其 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.一种食管癌基因甲基化检测的PCR引物探针组合,其特征在于,包括以下1)和2)所示的核酸序列组合:

1)DACH1甲基化检测的PCR引物及探针,包括引物探针组合1、引物探针组合3中的一种,其中所述引物探针组合1包括如SEQ ID NO.1所示的上游引物、如SEQ ID NO.2所示的下游引物以及如SEQ ID NO.3所示的荧光探针,所述引物探针组合3包括如SEQ ID NO.7所示的上游引物、如SEQ ID NO.8所示的下游引物以及如SEQ ID NO.9所示的荧光探针;

2)ZNF132甲基化检测的PCR引物及探针,包括引物探针组合5、引物探针组合6中的一种,其中所述引物探针组合5包括如SEQ ID NO.13所示的上游引物、如SEQ ID NO.14所示的下游引物以及如SEQ ID NO.15所示的荧光探针,所述引物探针组合6包括如SEQ ID NO.16所示的上游引物、如SEQ ID NO.17所示的下游引物以及如SEQ ID NO.18所示的荧光探针。

2. 如权利要求1所述的食管癌基因甲基化检测的PCR引物探针组合,其特征在于,还包括检测内参基因GAPDH的PCR引物及探针,其中,所述引物包括如SEQ ID NO.19所示的上游引物、如SEQ ID NO.20所示的下游引物,所述探针包括如SEQ ID NO.21所示的荧光探针。

3.如权利要求1或权利要求2所述的食管癌基因甲基化检测的PCR引物探针组合,其特征在于,所述荧光探针的5’端包含有荧光报告基团,所述荧光报告基团包括FAM、HEX、NED、ROX、TET、JOE、TAMRA、CY3、CY5中的任意一种。

4.如权利要求1或权利要求2所述的食管癌基因甲基化检测的PCR引物探针组合,其特征在于,所述荧光探针的3’端包含有荧光淬灭基团,所述荧光淬灭基团包括MGB、BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3中的任意一种。

5.一种食管癌基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1所述的PCR引物探针组合,还包括阳性质控品以及阴性质控品。

6.如权利要求5所述的食管癌基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,所述食管癌基因甲基化检测试剂盒反应体系的终浓度组成包括:0.1-1μM PCR引物、0.1-1μM探针。

7. 如权利要求5所述的食管癌基因甲基化检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的数字PCR反应条件如下:1)95℃ 2分钟;2)94℃ 30秒,54-60℃ 60秒,循环30-50次;3)98℃ 10分钟;4)冷却至4℃。

8.权利要求1所述的食管癌基因甲基化检测的PCR引物探针组合在制备检测食管癌试剂盒中的应用。

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