[发明专利]用于鉴别牛樟芝菌株的方法

权利要求书

1.一种用于鉴别牛樟芝菌株的方法，其特征在于：所述方法包括：

提供含有牛樟芝菌株的RPB2基因的DNA片段；以及

将所述DNA片段拿来与供比对的牛樟芝菌株的RPB2基因进行SNP基因分型，用来侦测所述牛樟芝菌株的RPB2基因的SNP位点上的碱基差异，

其中，若存在有至少一个SNP位点上的碱基差异，表示所述牛樟芝菌株是彼此不同的分离株。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述SNP基因分型是通过使用下列方法学的至少之一来进行：测序、限制性片段长度多态性分析、寡核苷酸接合分析、分子信标、5’-核酸酶分析、动态等位基因-特异性杂交、SNP微阵列、DNA-DNA杂交以及变性梯度凝胶电泳。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述至少一个SNP位点上的碱基差异存在选自于下列的RPB2基因的核苷酸残基位置：16、21、22、25、31、34、40、76、79、80、81、82、83、85、91、93、100、101、107、113、114、115、175、244、253、256、295、337、349、403、409、418、424、440、463、475、481、484、508、541、547、661、673、682、685、725、727、754、775、796、799、832、844、877、922、1066、1078、1085、1089、1096、1102、1105、1108、1113处，以及它们的组合。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述至少一个SNP位点上的碱基差异存在选自于下列的RPB2基因的核苷酸残基位置：16、25、31、34、76、79、80、81、82、83、93、100、101、107、113、114、115、295、349、409、418、463、475、484、508、661、673、685、725、727、754、775、796、799、922、1066、1078、1105，以及它们的组合。

5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述SNP位点上的碱基差异的侦测包括侦测下列的RPB2基因的核苷酸残基位置：16、25、31、295、349、418以及1105。

6.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述SNP位点上的碱基差异的侦测包括侦测下列的RPB2基因的核苷酸残基位置：16、25、31、295、349、463以及1105。

7.根据权利要求3所述的方法，其特征在于：所述SNP位点上的碱基差异的侦测包括侦测下列的RPB2基因的核苷酸残基位置：16、25、31、295、349、475以及1105。

8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述供比对的牛樟芝菌株选自于由下列所构成的群组：BCRC 35396、BCRC 35398、BCRC 37609、BCRC 37941，以及它们的组合。