[发明专利]一种结核分枝杆菌的突变基因及其应用

说明书

本发明属于生物医药的技术领域，本发明提供了一种结核分枝杆菌的突变基因及其应用。所述突变基因是在结核分枝杆菌标准株H37Rv基因中缺失了基因片段Rv1527c的突变基因，或结核分枝杆菌的Rv1527c基因片段上第1380位的丙氨酸突变为脯氨酸或第1637位的甘氨酸突变为丙氨酸的突变基因。将上述突变基因作为结核分枝杆菌的生物标志物，用于结核病患者治疗前临床标本检测，有利于临床制定合理的化疗方案，从而提高临床结核病、尤其是耐多药结核病患者的治疗成功率。

技术领域

本发明涉及生物医药技术领域，尤其涉及一种结核分枝杆菌的突变基因及其应用。

背景技术

氨基糖苷类是世界卫生组织推荐的注射用抗结核药物，包括链霉素(STR)、阿米卡星(AMI)和卡那霉素(KAN)。STR主要用于普通结核病的治疗，而AMI和KAN目前是治疗耐多药结核病(multidrug-resistant tuberculosis，MDR-TB，指结核分枝杆菌同时耐利福平和异烟肼两种抗结核药物)的核心二线药物。STR、AMI和KAN作用于结核分枝杆菌(Mtb)的核糖体，干扰细菌蛋白正常合成，在体外有较强的杀菌活性。目前已知rrs、rpsL、eis启动子和tlyA基因突变与结核分枝杆菌对氨基糖苷类耐药有关。

结核分枝杆菌对链霉素(STR)耐药主要与rrs和rpsl基因突变有关：rrs A514C突变可能与STR低度耐药相关；rpslK43R突变与STR高度耐药相关，rpslK88Q/R突变与STR中低度耐药相关。在不同的研究中，24％～89％链霉素表型耐药菌株携带了rpslK43R突变，5％～27％携带rpslK88Q/R突变。总体上，75％～90％的链霉素耐药菌中存在rrs或rpsl的相关耐药突变。结核分枝杆菌对卡那霉素(KAN)与阿米卡星(AMI)耐药主要与rrs和eis基因突变有关，研究显示，rrsA1408G与临床分离株的KAN高浓度耐药密切相关。56％的KAN耐药株携带了rrsA1408G突变；78％的AMI耐药株携带了rrs A1408G突变。eis突变与KAN和AMI的低浓度耐药相关，但该现象仅出现在体外试验中。在已发表的数据中，22％的KAN耐药株携带了eisA-10A突变，13％携带C-12T突变，11％携带了C-14T突变，5％携带了G-37T突变。结核分枝杆菌对STR、KAN、AMI三药均耐药的基因型改变是rrsA1401G突变联合rpsL突变，或者联合rrsA514C突变。

然而，结核分枝杆菌(Mtb)对氨基糖苷类抗结核药物之间存在交叉耐药性，抗生素使用不当可能导致治疗无效并且增加药物的不良反应。目前已有氨基糖苷类抗结核药物的分子药敏检测技术，针对rrs或rpsl基因突变检测，STR耐药菌可达75％～90％的检测率，但对AMI和KAN耐药菌的检测仅有5％～78％，敏感性和特异性均有待提高。且已有氨基糖苷类抗结核药物的分子药敏检测技术不能直接指导临床用药，因此难以提高治愈率。因此，深入了解结核分枝杆菌临床分离菌对氨基糖苷类药物的耐药性，有助于耐药的快速诊断，有利于临床制定合理的化疗方案。

发明内容

本发明的目的在于提供一种结核分枝杆菌的突变基因，并将该突变基因作为结核分枝杆菌的生物标志物。

为了实现上述发明目的，本发明提供以下技术方案：

本发明提供了一种结核分枝杆菌的突变基因，所述突变基因是在结核分枝杆菌标准株H37Rv基因中缺失了基因片段Rv1527c的突变基因，或结核分枝杆菌的Rv1527c基因片段上第1380位的丙氨酸突变为脯氨酸或第1637位的甘氨酸突变为丙氨酸的突变基因。

优选的，所述基因片段Rv1527c(ID:886442)位于结核分枝杆菌标准株H37Rv基因中的第1722083～1728409位。

优选的，所述结核分枝杆菌标准株H37Rv的基因登录号为NC_000962.3。

本发明还提供了所述突变基因作为结核分枝杆菌生物标志物的应用。