[发明专利]分子标记IWB59718及其在检测小麦条锈病抗性中的应用

说明书

本发明公开了分子标记IWB59718及其在检测小麦条锈病抗性中的应用。本发明通过全基因组关联分析(GWAS)发现了位于小麦4B染色体长臂上抗条锈病位点QYr.hbaas‑4BL.3，解释表型变异3.9‑5.8％，其关联SNP IWB59718为二等位多态性SNP位点，为T或C，可用于检测小麦条锈病抗性，并用于抗条锈病分子育种。

技术领域

本发明涉及生物农业领域中，分子标记IWB59718及其在检测小麦条锈病抗性中的应用。

背景技术

小麦条锈病是一种由小麦条锈菌(Puccinia striiformisWestend.f.sp.tritici)引起的、世界范围内广泛发生的真菌病害。条锈病对小麦生产危害巨大，在病害流行年份可造成小麦严重减产甚至绝收。选育并合理运用抗病品种是防治小麦条锈病最经济有效的方法。国内外对条锈病抗性遗传进行了大量研究。迄今，已正式命名的小麦条锈病抗性基因有80多个。由于小麦条锈菌生理小种复杂多变，一些抗病基因已丧失抗性，发掘新的抗病基因并开发其连锁标记对丰富条锈病抗源、更好进行抗病育种意义重大。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)，是指由于单个核苷酸的变异而引起基因组水平上的DNA序列多态性。现阶段，可用电泳、直接测序、DNA芯片、竞争性等位基因特异性PCR(KASP)等对SNP进行检测，电泳方法效率较低，其他方法对设备和技术要求高、成本较高。PARMS(Penta-primer amplification refractory mutationsystem)检测技术，是一种基于扩增受阻突变体系PCR(ARMS PCR)的检测技术，与常规ARMSPCR不同的是，PARMS检测技术增加了两条带有不同荧光的检测引物，可以分别检测两条等位基因正向引物5’端的互补序列，经过与同一条反向引物PCR扩增以后，待检测位点的多态性即可通过不同的荧光信号得以检测出来。PARMS已陆续应用于分子辅助育种、目标性状基因定位、种子纯度及真实性鉴定等工作，具有成本低、通量高、实验操作安全和荧光信号采集数据准确等优势。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何检测小麦条锈病抗性。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了小麦抗病分子标记或检测所述小麦抗病分子标记的物质在检测或辅助检测小麦条锈病抗性中的应用；所述小麦抗病分子标记其名称为IWB59718，为对应于小麦基因组中序列表中序列4的第51位所示的核苷酸，所述小麦抗病分子标记为T或C。

所述小麦抗病分子标记位于小麦染色体4BL上，物理位置为578.0Mb的位点。

上述应用中，所述检测所述小麦抗病分子标记的物质可为PARMS_IWB59718引物组，所述PARMS_IWB59718引物组由名称分别为PARMS_IWB59718A、PARMS_IWB59718B和PARMS_IWB59718C的单链DNA组成；

所述PARMS_IWB59718A为(b1)或(b2)：

(b1)序列表的序列1的第22-42位所示的单链DNA；

(b2)将序列1的第22-42位经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加得到的单链DNA；

所述PARMS_IWB59718B为(b3)或(b4)：

(b3)序列表的序列2的第22-42位所示的单链DNA；

(b4)将序列2的第22-42位经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加得到的单链DNA；

所述PARMS_IWB59718C为序列表的序列3所示的单链DNA。

上述应用中，(b2)可为序列表中序列1所示的单链DNA；(b4)可为序列表中序列2所示的单链DNA。