[发明专利]用于早佳丝瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物及方法在审
申请号: | 202010601289.8 | 申请日: | 2020-06-29 |
公开(公告)号: | CN111961740A | 公开(公告)日: | 2020-11-20 |
发明(设计)人: | 韩小霞;胡新军;李勇奇;闵子扬;袁祖华 | 申请(专利权)人: | 湖南省蔬菜研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 长沙和雅知识产权代理事务所(普通合伙) 43238 | 代理人: | 林传贵 |
地址: | 410000 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 丝瓜 杂交 种子 纯度 鉴定 ssr 引物 方法 | ||
1.一种用于早佳丝瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物,其特征在于,所述引物包括上游引物SF32和下游引物SR32,所述上游引物SF32的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述下游引物SR32的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
2.一种早佳丝瓜杂交种子纯度的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取早佳丝瓜亲本以及杂交种后代基因组DNA;
(2)以所述步骤(1)提取的基因组DNA为模板,使用权利要求1所述引物SF32和SR32进行PCR扩增,得到扩增产物;
(3)对步骤(2)所述扩增产物采用凝胶电泳检测,显色,统计电泳结果;
(4)对步骤(3)所述电泳结果进行分析,同时具有亲本特异性条带的单株为杂交种,缺少其中任意一条带则为假杂种。
3.根据权利要求2所述的一种早佳丝瓜杂交种子纯度的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(1)中基因组DNA的提取方法具体为:将待提取样品放入PCR板中,并加入0.25mol/L的NaOH溶液50μl,沸水中煮3min,用镊子取出PCR板,加入0.1mol/L pH=8.0的Tris﹒HCl 150μl中和反应。
4.根据权利要求2所述的一种早佳丝瓜杂交种子纯度的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(2)中PCR反应体系为10μl,其中:10ng/μl基因组DNA 0.5μl,10×PCR Buffer 1μl,10mmol/l dNTP 0.1μl,20pmol/l SSR上下游引物各0.1μl,2.5U/μlrTaq DNADNA聚合酶0.1μl,加灭菌ddH2O至总体积10μl。
5.根据权利要求2或4所述的一种早佳丝瓜杂交种子纯度的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(2)中PCR反应程序为:94℃预变性4min,94℃变性30s,52.5℃退火30s,72℃延伸30s,共25个循环,最后72℃延伸3min。
6.根据权利要求2所述的一种早佳丝瓜杂交种子纯度的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(3)中凝胶电泳为8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。
7.根据权利要求2所述的一种早佳丝瓜杂交种子纯度的鉴定方法,其特征在于,所述步骤(3)中显色具体为:电泳结束后,分开两块玻璃板,将凝胶放在专用盆中,加入蒸馏水清洗2-3遍后,放入染色液中,染色完成后取出胶板,用蒸馏水漂洗2-3次;将胶板放入显影液中,轻轻摇动,待条带清晰后,迅速用蒸馏水漂洗2-5遍后将胶板置于胶片观察灯上,拍照记录。
8.如权利要求1所述的SSR引物SF32和SR32在早佳丝瓜杂交种纯度鉴定及分子辅助育种中的应用。
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