[发明专利]一种用于腺瘤及结直肠癌早期诊断的标志物组合及试剂盒在审
申请号: | 202010614326.9 | 申请日: | 2020-06-30 |
公开(公告)号: | CN111778332A | 公开(公告)日: | 2020-10-16 |
发明(设计)人: | 贾卫华;曹连静 | 申请(专利权)人: | 中山大学;中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院;中山大学肿瘤研究所) |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11;G16B25/20;G16B40/20 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 段卉 |
地址: | 510275 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 腺瘤 直肠癌 早期 诊断 标志 组合 试剂盒 | ||
1.一种用于腺瘤及结直肠癌早期诊断的标志物组合,其特征在于,所述标志物组合为ITGA4和Pa;所述ITGA4和Pa的引物和探针包括检测ITGA4启动子区甲基化的引物、探针,检测内参ACTB的引物、探针,检测Pa相对表达量的引物和检测细菌16s rRNA表达量的引物,其序列依次如SEQ ID No:1~10所示。
2.权利要求1所述标志物组合在制备用于腺瘤及结直肠癌早期诊断的试剂盒中的应用。
3.一种用于腺瘤及结直肠癌早期诊断的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物和探针。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,还包括实时荧光定量PCR扩增反应试剂、粪便DNA保护液和DNA提取试剂。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述实时荧光定量PCR扩增反应试剂包括Taq DNA聚合酶、PCR dNTPs、镁离子、扩增反应缓冲液和无酶水。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述粪便DNA保护液包括Tris 200~500mM,EDTA 100~300mM,NaCl 5~15mM。
7.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA提取试剂包括裂解液、蛋白酶K溶液、漂洗液和无酶水。
8.权利要求3~7任一所述试剂盒的使用方法,其特征在于,用权利要求1所述的引物和探针对待测样本DNA进行实时荧光定量PCR扩增,并对待测样本进行FIT检测,将得到的实时荧光定量PCR扩增和FIT检测结果代入logistic回归模型,对结果进行判定。
9.根据权利要求8所述的使用方法,其特征在于,所述logistic回归模型为:Y=-17.92402+0.41305×ITGA4-3.82119×FIT+0.32374×Pa;式中,ITGA4代表ITGA4的CT值,Pa代表Pa相对表达量,FIT为1或0。
10.根据权利要求9所述的使用方法,其特征在于,所述判定的方法为:当Y值≤0.82214,判定待测样本为阳性;当Y值>0.82214时,判定待测样本为阴性。
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