[发明专利]与花椰菜花球底部花梗分枝角度连锁的SNP标记及方法和应用

说明书

本发明公开了与花椰菜花球底部花梗分枝角度连锁的SNP标记及方法和应用，该SNP标记具有如SEQ ID NO1、SEQ ID NO2、SEQ ID NO3和SEQ ID NO4中任意一个所示的核苷酸序列。本发明的SNP标记及方法，利用花梗分枝角度性状连锁的分子标记，开发出适宜高通量检测的KASP引物，具有时效性强、适合高通量检测的优点，对种质资源或育种材料进行鉴定，可以大大提高育种效率，减少育种选择的盲目性，是加快花球形状育种改良进程的有力工具。

技术领域

本发明涉及一种SNP标记，具体涉及一种与花椰菜花球底部花梗分枝角度连锁的SNP标记及方法和应用。

背景技术

花椰菜的花球形状有平底和斜底之分。平底花球一般较为紧实，花梗颜色较白；而斜底花球一般较为松散，花梗由于更易受到阳光照射而较绿。目前市场对于绿梗的消费需求日益提高。因此，通过选育斜底花球的花椰菜品种而使花梗更绿是花椰菜育种的重要方向之一。

参照图1(图中SA表示角)，区别平底和斜底花球的最重要指标是花球底部花梗的分枝角度，平底的花球底部花梗的分枝角度大，斜底花球的花球底部花梗的分枝角度小。分枝角度具有较高的遗传力，可以通过人工选择进行品种的性状改良。

然而，由于花椰菜花球器官的独特性和分子生物学研究的相对滞后性，以往针对花球性状的品种改良均以基于表型选择的传统手段为主，周期较长，效率较低，且易受环境和季节的影响。

发明内容

本发明的目的是提供一种与花椰菜花球底部花梗分枝角度连锁的SNP标记，解决基于表型选择的品种改良存在周期长且效率低的问题，能够通过SNP标记快速鉴定出花椰菜的花球底部花梗分枝角度性状。

为了达到上述目的，本发明提供了一种与花椰菜花球底部花梗分枝角度连锁的SNP标记，该SNP标记具有如SEQIDNO1、SEQIDNO2、SEQIDNO3和SEQIDNO4中任意一个所示的核苷酸序列。

优选地，具有所述SEQIDNO1或SEQIDNO2所示的核苷酸序列的花椰菜的花球底部花梗分枝角度小；具有所述SEQIDNO3或SEQIDNO4所示的核苷酸序列的花椰菜的花球底部花梗分枝角度大。

本发明的另一目的是提供一种对花椰菜的花球底部花梗分枝角度鉴定的KASP引物组，该KASP引物组为引物组1或引物组2。

其中，所述引物组1具有如SEQIDNO5所示的核苷酸序列的正向引物1、如SEQIDNO6所示的核苷酸序列的正向引物2和如SEQIDNO7所示的核苷酸序列的反向引物。

所述引物组2具有如SEQIDNO8所示的核苷酸序列的正向引物1、如SEQIDNO9所示的核苷酸序列的正向引物2和如SEQIDNO10所示的核苷酸序列的反向引物。

优选地，所述引物组1用于鉴定区分具有所述SEQIDNO1和SEQIDNO3所示的核苷酸序列的花椰菜；所述引物组2用于鉴定区分具有所述SEQIDNO2和SEQIDNO4所示的核苷酸序列的花椰菜。

本发明的另一目的是提供一种用于鉴定花椰菜花球底部花梗分枝角度的试剂盒，该试剂盒中的引物采用所述的KASP引物组。

本发明的另一目的是提供一种花椰菜花球底部花梗分枝角度的鉴定方法，该方法采用KASP反应体系进行PCR扩增，通过扩增产物进行判断：

具有所述SEQIDNO1或SEQIDNO2所示的核苷酸序列的花椰菜的花球底部花梗分枝角度小；具有所述SEQIDNO3或SEQIDNO4所示的核苷酸序列的花椰菜的花球底部花梗分枝角度大。

其中，所述KASP反应体系中采用的引物为所述的KASP引物组。