[发明专利]水稻钠钾离子吸收QTL连锁的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.水稻钠钾离子吸收QTL qK/Na-3-1连锁的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记位于IRGSP-1.0基因组版本的Chr3染色体短臂上，位于qK/Na-3-1内部：

SNP分子标记RS(36172492)，序列如SEQ ID NO.1所示，其序列第47bp处位点的多态性为T/G，第48bp处位点的多态性为G/-；

SNP分子标记RS(36174628)，序列如SEQ ID NO.2所示，其序列第18bp处位点的多态性为A/-。

2.用于检测水稻钠钾离子吸收QTL qK/Na-3-1连锁的SNP分子标记的特异性引物组合，其特征在于，针对SNP分子标记RS(36172492)的引物序列如SEQ ID NO.3-4所示，针对SNP分子标记RS(36174628)的引物序列如SEQ ID NO.5-6所示。

3.如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)或如权利要求2所述特异性引物组合在鉴定水稻钠钾离子吸收QTL qK/Na-3-1中的应用。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，是以待测植株样品的基因组DNA作为模板，用PCR引物进行定量PCR扩增，利用扩增结果进行基因型分型，将能够读取到上述SNP分子标记的RS(36172492)、RS(36174628)的多态性分别是(T/G)(G/-)、(A/-)的植株鉴定为含有水稻钠钾离子吸收QTL qK/Na-3-1的植株。

5.如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)或如权利要求2所述特异性引物组合在鉴定水稻潜在耐盐性中的应用。

6.如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)或如权利要求2所述特异性引物组合在鉴定水稻钠钾离子吸收潜在候选基因中的应用。

7.如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)或如权利要求2所述特异性引物组合在水稻钠钾离子吸收性状候选基因挖掘中的应用。

8.如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)或如权利要求2所述特异性引物组合在水稻潜在耐盐性遗传资源挖掘中的应用。

9.如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)或如权利要求2所述特异性引物组合在水稻种质资源改良或在潜在耐盐性水稻材料创制或在水稻分子辅助育种中的应用。

10.一种快速鉴定水稻钠钾离子吸收QTL qK/Na-3-1的分子标记方法，其特征在于，是以双亲杂交获的F₁代植株，对F₁代花药小孢子进行游离培养，获取双单倍体株系的DH群体，获取DH群体的2个极端池，利用如权利要求1所述SNP分子标记RS(36172492)、RS(36174628)和BSA的分析策略快速鉴定水稻钠钾离子吸收QTL区域。