[发明专利]GARNL1基因与鸡种睾丸性状相关性的检测方法及应用

说明书

本发明公开了一种GARNL1基因与鸡种睾丸性状相关性的检测方法及应用，属于基因工程领域，该方法先提取待检测鸡种的基因组DNA，再扩增GARNL1基因5’调控区rs14532831位点上下游463bp片段，再将得到的PCR产物使用RFLP分型，再统计分析GARNL1基因位点rs16492031不同基因型与公鸡睾丸性状的相关性；本发明是采用一种检测鸡种GARNL1基因rs14532831位点的多态性与鸡种睾丸性状相关性的关系，并利用这种关系和方法作为鸡种品种选育和标记的的手段。这种选育方法相较于现在的屠宰选育，不仅成本低、操作简便，并且结果准确。

技术领域

本发明涉及基因工程领域，特别是涉及一种GARNL1基因与鸡种睾丸性状相关性的检测方法及应用。

背景技术

GTPase-activating Rap/RanGAP domain-like 1protein(GARNL1)基因目前在鸡上的研究极少(Chen等，2006，2007；Shen等，2012)，而且集中在该基因与母鸡繁殖性能如产蛋量、就巢性、开产日龄等方面。人GARNL1的研究表明，它与神经表型和家族基底节钙化症(Familial idiopathic basal ganglia calcification，IBGC；又称Fahr disease)相关(Schwarzbraun等，2004)，且与脑部发育停滞相关(Shimojima等，2009)。迄今为止，GARNL1基因与地方鸡种公禽的繁殖性能还未见有报道。

睾丸是雄性动物重要的生殖器官，具有产生精子和分泌雄激素的功能。在优质鸡育种中，睾丸性状不仅仅是蛋鸡的重要经济性状，更是肉鸡选育的一个重要经济性状(顾敏清，2008；Orlu等，2009；Sarabia等，2013)。种公鸡睾丸大小和重量与精子、精液的数量和质量有直接联系，对鸡群受精率的高低和维持很重要，而且繁殖后期种公鸡的繁殖机能逐渐减退，精液品质大幅下降，从而缩短种公鸡的使用寿命。同时鸡睾丸作为优质鸡消费副产品有着重要的医药及经济价值，我国广东、福建、台湾等地消费者有着食用鸡鹅等禽类睾丸的习惯，目前市场售价可达100元/kg，一只公鸡的睾丸按20g计算，附加值达2元，如果能提高公鸡睾丸的重量则意味着可以提高公鸡的附加值。有研究发现地方鸡种睾丸性状在群体中的变异系数高达80％以上(周敏等，2019)。而评价睾丸生长发育的指标如左右两侧的睾丸重、睾丸指数、睾丸总重是屠宰性状，如直接选择这些指标，在现场育种中必须进行大量的屠宰后通过同胞值进行选择，该方法成本高，工作繁琐。随着分子遗传标记辅助选择在育种中的应用，候选基因法是家鸡进行睾丸性状分子选育行之有效、易于操作的方法。Shen等(2012)发现rs14532831位点与鸡开产日龄显著相关(P0.05)，但该位点是否与鸡种睾丸性状相关还未见报道。

发明内容

本发明的目的是提供一种GARNL1基因与鸡种睾丸性状相关性的检测方法及应用，以解决上述现有技术存在的问题，并利用这种关系和方法作为鸡种品种选育和标记的的手段。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种GARNL1基因与鸡种睾丸性状相关性的检测方法，包括以下步骤：

(1)提取待检测鸡种的基因组DNA；

(2)采用PCR反应扩增GARNL1基因5’调控区rs14532831位点上下游463bp片段；

(3)将得到的PCR产物使用RFLP分型；

(4)采用SAS 9.0GLM程序进行统计分析GARNL1基因位点rs14532831不同基因型与睾丸性状的相关性。

进一步地，所述步骤(2)中引物序列：F:5’-cctccttccacagccttccttta-3’，R:5’-ttgcatctactgggtgggaattg-3’。