[发明专利]GARNL1基因与公鸡鸡冠和肉垂性状相关性的检测方法及应用

说明书

本发明公开了一种GARNL1基因与公鸡鸡冠和肉垂性状相关性的检测方法及应用，属于基因工程领域，该方法先提取待检测鸡种的基因组DNA，再扩增GARNL1基因内含子32中rs16492031位点上下游752bp片段，再将得到的PCR产物使用RFLP分型，再统计分析GARNL1基因位点rs16492031不同基因型与公鸡鸡冠和肉垂性状的相关性；本发明是采用一种检测鸡种GARNL1基因内含rs16492031位点的多态性与公鸡鸡冠和肉垂性状相关性的关系，并利用这种关系和方法作为鸡种品种选育和标记的的手段。这种选育方法相较于现在的世代选育，不仅成本低、操作简便，并且结果准确。

技术领域

本发明涉及基因工程领域，特别是涉及一种GARNL1基因与公鸡鸡冠和肉垂性状相关性的检测方法及应用。

背景技术

在家鸡育种中，性早熟性状主要是从开产日龄、鸡冠的发育与肉垂的发育等方面进行选育。张德祥(1999)研究认为，以鸡冠面积为指标选择优质鸡早熟性是可行的。韦凤英等(2002)以鸡冠面积作为主要指标在银香麻鸡开展早熟性状选择，结果发现经过5代的选育公鸡配种日龄提早了23天，母鸡开产日龄提早了15天，400日龄产蛋提高了20枚。季从亮等(2008)研究发现早期鸡冠高度与性成熟之间存在相关性，鸡冠发育与开产日龄具有相关性。近几年来有关鸡性早熟性状选育大多是通过世代选育的方法不断从后备鸡群中选择早熟个体，建立核心群后扩繁和选育，这种方法比较缓慢且稳定性较差。目前对性早熟的研究主要集中在母鸡中，对于公鸡性早熟的研究还未见报道。随着分子遗传标记辅助选择在育种中的应用，候选基因法是家鸡进行性早熟分子选育行之有效、易于操作的方法。

人GTPase-activating Rap/RanGAP domain-like 1protein(GARNL1)基因的研究表明，它与神经表型和家族基底节钙化症(Familial idiopathic basal gangl iacalcification，IBGC；又称Fahr disease)相关(Schwarzbraun等，2004)，且与脑部发育停滞相关(Shimojima等，2009)。目前在鸡上的研究较少(Chen等，2006，2007；Shen等，2012)，而且集中在该基因与母鸡繁殖性能如产蛋量、就巢性、开产日龄等方面。Shen等(2012)发现rs16492031位点与母鸡开产日龄极显著相关(P0.01)，但该位点是否与公鸡的鸡冠、肉垂性状相关还未见报道。

发明内容

本发明的目的是提供一种GARNL1基因与公鸡鸡冠和肉垂性状相关性的检测方法及应用，以解决上述现有技术存在的问题，并利用这种关系和方法作为鸡种品种选育和标记的手段。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种GARNL1基因与公鸡鸡冠和肉垂性状相关性的检测方法，包括以下步骤：

(1)提取待检测鸡种的基因组DNA；

(2)采用PCR反应扩增GARNL1基因内含子32中rs16492031位点上下游752bp片段；

(3)将得到的PCR产物使用RFLP分型；

(4)采用SAS 9.0GLM程序进行统计分析GARNL1基因位点rs16492031不同基因型与公鸡鸡冠和肉垂性状的相关性。

进一步地，所述步骤(4)中采用SAS 9.0GLM程序进行统计分析，构建模型如下：Y_ij＝μ+G_i+e_ij，其中Y_ij为性状表型值，μ为该性状的总体均值，G_i为基因型效应值，e_ij为随机残差效应。

本发明还提供一种GARNL1基因位点rs16492031基因型在检测公鸡鸡冠和肉垂性状相关性中的应用。