[发明专利]一种甘薯黑斑病菌的实时荧光RPA检测引物及其应用有效

专利信息
申请号: 202010739982.1 申请日: 2020-07-28
公开(公告)号: CN111705159B 公开(公告)日: 2022-02-22
发明(设计)人: 高波;马娟;李秀花;李焦生;王容燕;陈书龙 申请(专利权)人: 河北省农林科学院植物保护研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 北京安度修典专利代理事务所(特殊普通合伙) 11424 代理人: 胡长远
地址: 071000 *** 国省代码: 河北;13
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摘要:
搜索关键词: 一种 甘薯 黑斑 病菌 实时 荧光 rpa 检测 引物 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于检测甘薯黑斑病菌的RPA引物和探针组合,其特征在于,所述的RPA引物由SEQ ID No:1和SEQ ID No:2所示的核苷酸序列组成;所述的探针由SEQ ID No:3所示的核苷酸序列组成。

2.权利要求1所述的RPA引物和探针组合在检测甘薯黑斑病菌上的应用。

3.一种甘薯黑斑病菌的检测试剂盒,其特征在于,所述的检测试剂盒包含权利要求1所述的RPA引物和探针组合。

4.根据权利要求3所述的检测试剂盒,其特征在于,所述的检测试剂盒还包括再水化缓冲液、280mM醋酸镁、RPA冻干酶粉和ddH2O;所述的RPA冻干酶粉是RPA扩增反应所需要的重组酶、单链结合蛋白和DNA聚合酶的混合物。

5.根据权利要求4所述的检测试剂盒,其特征在于,所述的检测试剂盒包括:RPA冻干酶粉,再水化缓冲液 29.5 μL,10 μM上游引物 2.1 μL,10 μM下游引物 2.1 μL,10 μM探针0.6 μL,DNA模板 2 μL,ddH2O 11.2 μL,280mM醋酸镁 2.5 μL。

6.权利要求3-5任一所述的检测试剂盒在鉴定甘薯黑斑病菌上的应用。

7.利用权利要求1所述的RPA引物或探针组合对甘薯黑斑病菌进行实时荧光RPA检测的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)提取待测真菌DNA:利用Fungal gDNA Kit 试剂盒提取,并按照说明书进行操作;

(2)配制RPA反应体系:在含有RPA冻干酶粉的反应管中依次加入如下组分:再水化缓冲液29.5 μL,10 μM上游引物 2.1 μL,10 μM下游引物2.1 μL,10 μM探针 0.6 μL,待测样品DNA 2 μL,ddH2O 11.2 μL,280mM醋酸镁2.5 μL;充分混合均匀;

(3)RPA扩增及结果的判读:将步骤(2)的反应管置于恒温荧光核酸扩增仪中,在39℃反应20 min,且每20 s收集一次荧光信号,采集荧光数据,并在反应第4 min时取出反应管并混匀反应液,然后再放回恒温荧光核酸扩增仪继续反应;绘制时间-荧光信号图,构建扩增曲线;如果获得扩增曲线,则判定为阳性,反之,无扩增曲线则判定为阴性。

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