[发明专利]一种影响猪个体中鸟嘌呤含量的SNP标记有效
申请号: | 202010749748.7 | 申请日: | 2020-07-30 |
公开(公告)号: | CN111705145B | 公开(公告)日: | 2021-07-13 |
发明(设计)人: | 黄路生;麻骏武;黄聪;郑敏;肖石军;杨斌 | 申请(专利权)人: | 江西农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11;C12N15/90;A01K67/027 |
代理公司: | 北京聿华联合知识产权代理有限公司 11611 | 代理人: | 贾艳华 |
地址: | 330045 江西省南*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 影响 个体 嘌呤 含量 snp 标记 | ||
1.一种猪的SNP标记,所述SNP标记为如下SNP标记中的至少一种:
(I)SEQ ID No. 1上的从5’端起的第301位点的核苷酸,所述核苷酸为G或A,对应于11.1版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第55495763位点的核苷酸;
(II)SEQ ID No. 2上的从5’端起的第331位的核苷酸,所述核苷酸为C或CT,对应于11.1版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第55500274位点;
(III)SEQ ID No. 3上的从5’端起的第301位点的核苷酸,所述核苷酸为T或C,对应于11.1版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第54924843位点。
2.检测如权利要求1所述的SNP标记的试剂在确定猪肉中鸟嘌呤含量高低中的应用。
3.一种猪的遗传改良的方法,所述方法包括:确定种猪核心群中的种猪的如权利要求1所述的SNP标记,并根据所述SNP标记做出相应的选择:
(I),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No. 1上的从5’端起的第301位点为G/A和A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
(II),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No. 2上的从5’端起的第331位点为C/CT和CT/CT基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/C基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因CT的频率;
(III),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No. 3上的从5’端起的第301位点为T/C和C/C基因型的种猪个体,淘汰在该位点为T/T基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因C的频率。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,对于(I),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No. 1上的从5’端起的第301位点为A/A基因型的种猪个体,淘汰在该位点为G/A和G/G基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因A的频率;
对于(II),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No. 2上的从5’端起的第331位点为CT/CT基因型的种猪个体,淘汰在该位点为C/CT和C/T基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因CT的频率;
对于(III),在所述种猪核心群中选择在所述SEQ ID No. 3上的从5’端起的第301位点为C/C基因型的种猪个体,淘汰在该位点为T/C和T/T基因型的种猪个体,以逐代提高该位点的等位基因C的频率。
5.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如权利要求1所述的SNP标记,其中所述核酸的序列选自包含所述(I)中的SNP标记的核酸I、包含所述(II)中的SNP标记的核酸II和包含所述(III)中的SNP标记的核酸III中的至少一种。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述核酸I、核酸II和核酸III独立地选自DNA序列、cDNA序列和RNA序列中的至少一种。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述核酸I至核酸III独立地具有5bp至26560 bp的长度。
8.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述核酸I至核酸III独立地具有5bp至10000bp的长度。
9.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述核酸I至核酸III独立地具有5bp至5928 bp的长度。
10.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述核酸I至核酸III独立地具有5bp至1000 bp的长度。
11.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述核酸I至核酸III独立地具有5bp至500 bp的长度。
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