[发明专利]一种检测大豆线虫的引物和探针及方法在审
申请号: | 202010757312.2 | 申请日: | 2020-07-31 |
公开(公告)号: | CN111662991A | 公开(公告)日: | 2020-09-15 |
发明(设计)人: | 吴骁轶;王斌 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6804;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 丁静静 |
地址: | 210008 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 大豆 线虫 引物 探针 方法 | ||
1.一种检测大豆线虫的引物和探针,其特征在于,包括如下核苷酸序列:
(1)检测线虫病的PCR引物:其核苷酸序列如SEQ ID NO:1~2所示;
(2)检测胞囊线虫的探针:其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;
(3)检测结线虫的探针:其核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
2.根据权利要求检测大豆线虫的引物和探针,其特征在于,SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示序列的3’端修饰Biotin;
SEQ ID NO:3所示序列的5’端修饰FITC;
SEQ ID NO:4所示序列的5’端修饰DIG。
3.根据权利要求1所述的检测大豆线虫的引物和探针,其特征在于,所述的大豆线虫包括:Heterodera glycines、Heterodera sojae、Meloidogyne incognita、Meloidogynejavanica、Meloidogyne arenaria。
4.权利要求1或2所述检测大豆线虫的引物和探针在制备大豆线虫检测试剂中的应用。
5.一种检测大豆线虫的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待测样品的核糖体DNA;
(2)以步骤(1)提取的DNA为模板、SEQ ID NO:1~2所示的序列为引物进行PCR扩增,其中,SEQ ID NO:1~2所示的序列的3’端修饰Biotin;
(3)向步骤(2)得到的PCR产物中分别加入SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4所示的探针,其中SEQ ID NO:3所述序列的3’端修饰FITC,SEQ ID NO:4所示序列的3’端修饰DIG,梯度退火杂交;
(4)将步骤(3)得到的杂交液与展开液混合,滴在大豆线虫病的核酸层析试纸上,所述大豆线虫病的核酸层析试纸上设有检测线1、检测线2、质控线,其中检测线1喷涂抗FITC的抗体,检测线2喷涂抗DIG的抗体,质控线喷涂生物素;
(5)若质控线、检测线1显色,检测线2不显色,则判定待测样品中含有大豆胞囊线虫;
若质控线、检测线2显色,检测线1不显色,则判定待测样品中含有大豆根结线虫;
若质控线显色,检测线1、检测线2不显色,则判定待测样品中不含有大豆胞囊线虫或大豆根结线虫;
若质控线不显色,判定结果无效。
6.根据权利要求5所述的检测大豆线虫的方法,其特征在于,步骤(2)中,PCR体系如下:1μL DNA、2μL dNTP、2μL DreamTaq缓冲液、0.3μL Dream Taq、SEQ ID NO:1和2所示的引物各1μL、13μL双蒸水;
PCR条件如下:94℃变性5min;94℃变性30s,54℃退火30s,72℃延伸1min,35个循环;最后72℃延伸5min,冷却至12℃。
7.根据权利要求5所述的检测大豆线虫病的方法,其特征在于,步骤(4)中,所述的核酸层析试纸包括:样品垫(1)、结合垫(2)、层析膜(3)、吸收垫(7)、固定板(8);所述的样品垫(1)、结合垫(2)、层析膜(3)、吸收垫(7)通过压敏粘合剂依次组装在固定板(8)上;
所述的样品垫(1)是检测样品的滴加位置,其材质为纤维素,制作核酸层析试纸前将样品垫置于样品垫处理液中静置10min,取出后置37℃烘干,密闭保存备用,所述的样品垫处理液的配方如下体积分数的物质:0.5%Tritonx-100、0.5%BSA、1%Tween-20溶于0.01M的PBS,调至PH8.0;
所述的结合垫(2)为胶体金结合垫,所述的胶体金结合垫的材质是玻璃纤维,制作前将结合垫置于链霉亲和素修饰的纳米金颗粒中的浸涂,然后37℃烘干备用;
所述的层析膜(3)的材质是高分子硝酸纤维素膜,层析膜(3)上喷涂有检测线1、检测线2、质控线,其中检测线1喷涂抗FITC的抗体,检测线2喷涂抗DIG的抗体,质控线喷涂生物素,其中所述检测线1、检测线2、质控线间间距0.6cm;
所述的吸收垫(7)用于吸收检测后的样本,其材质为纤维素,
所述的固定板(8)为样品垫(1)、结合垫(2)、层析膜(3)、吸收垫的(7)背衬底板。
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