[发明专利]一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法

权利要求书

1.一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述疲劳标志疾病知识图谱是以疲劳为首发症状的疾病为对象构建的医学知识图谱，构建方法的具体步骤如下：

S1、知识获取：从文献网站、相关数据库以及预留补充数据库中提取关于疲劳诊断、疲劳蛋白标志物参数、疲劳症状疾病的结构化数据、半结构化数据和非结构化数据，进行翻译、构建词向量、分句和词形的规范化处理；

S2、知识建模：根据概念、实体、关系、属性四个部分构建疲劳标志疾病知识图谱模型；

S3、知识融合：不同的知识库，收集知识的侧重点不同，将多个知识库中的知识进行整合、提取，从而获得实体的完整描述，完善疲劳标志疾病知识图谱模型；

S4、构建知识图谱：将疲劳标志疾病知识图谱模型，抽取实体和关系，存储在Neo4j图数据库，得到疲劳标志疾病知识图谱。

2.根据权利要求1所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述步骤S1中的提取是通过D2R将文献网站、相关数据库以及预留补充数据库中的非结构化文本信息转化为RDF三元组。

3.根据权利要求1所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述步骤S1中的提取还包括从ICD-10、临床医学知识库中进行人工提取。

4.根据权利要求1所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述步骤S2中疲劳标志疾病知识图谱模型以三元组的表示方法，即G∈（E,R,S），其中E={e1，e2,…, en}是知识库中的实体集合；R={r1，r2，…,rm}是知识库中的关系集合；S代表知识库中三元组集合即E*R*E，三元组的基本形式主要包括（实体1、关系、实体2）和（实体、属性、属性值），所述（实体、属性、属性值）用于描述实体的具体属性。

5.根据权利要求1所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述步骤S2中的概念包括标志蛋白、症状、疾病、检查、部位、药物六个概念。

6.根据权利要求5所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述概念标志蛋白对应的实体是疲劳生物蛋白标志物，包括免疫球蛋白kV-I、生长因子受体结合蛋白2、ADP-核糖基化酶、载脂蛋白-1、线粒体苹果酸脱氢酶、热休克同源71kDa蛋白、免疫球蛋白kV-III、高尔基体膜蛋白1、半胱氨酸蛋白酶抑制剂、黏液素、热休克蛋白β1、免疫球蛋白G3、丝氨酸蛋白酶抑制蛋白、RhoGDP解离抑制因子β、膜联蛋白A1、白蛋白、蛋白质二硫化物异构酶、免疫球蛋白kV-III、跨膜丝氨酸蛋白酶、核苷二磷酸激酶、杀菌通透性增加蛋白、泛素样修饰激活酶、巨噬细胞加帽蛋白、髓源生长因子、胰腺α-淀粉酶、L -乳酸脱氢酶B链、过氧化物酶-5、Prominin-1、角蛋白、唾液酸性富含脯氨酸蛋白。

7.根据权利要求1所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述步骤S3中知识融合包括模式层融合和数据层融合，数据层融合是节点合并、节点属性融合、冲突检测与解决；所述模式层融合需经过人工校验，保证信息的可靠性。

8.根据权利要求7所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述节点为实体。

9.根据权利要求1所述的一种疲劳标志疾病知识图谱的构建方法，其特征在于：所述疲劳标志疾病知识图谱的构建还包括知识推理法，将已有知识中隐含知识、模式或规则进行推理得出的准确概率。