[发明专利]一种食管癌新辅助放化疗疗效评估的生物标记

说明书

本发明公开了一种食管癌新辅助放化疗疗效评估的生物标记。MMP12蛋白作为生物标记物在制备食管癌新辅助放化疗疗效评估试剂、试剂盒或检测装置中的应用。MMP12的异常表达水平与食管鳞癌的TNM分期、淋巴结转移、生存时间显著相关(P0.05)，本发明通过微阵列数据分析确定了预测食管鳞癌患者nCRT反应的新生物标记物，MMP12可能是ESCC患者有用的肿瘤生物标志物和治疗靶点。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种食管癌新辅助放化疗疗效评估的生物标记。

背景技术

食管癌多数患者晚期诊断预后差，一旦发生转移，5年生存率将降至4％。对于局部晚期ESCC，术前新放化疗(nCRT)是治疗的主要组成部分。然而，病人在手术后常有疾病复发。同时，nCRT的预后也不同，nCRT 反应的患者生存时间更长，而无反应的患者预后更差。重要的是，nCRT可能增加术后并发症，临床参数(TNM分级、肿瘤位置)不能预测nCRT的反应。因此，通过识别新的生物标记物来预测nCRT反应，将有助于ESCC的管理。此外，它将帮助临床医生停止非有效治疗，从而避免过度治疗这些无反应的病人。

近年来，基因芯片分析和RNA测序技术的发展为探索基因表达变异与临床预后的关系提供了有利的信息。本研究在RNA测序和生物信息学分析的基础上，对ESCC中nCRT应答组和非应答组的差异表达基因(DEGs) 或差异表达miRNA进行了鉴定。此外，我们还构建了蛋白质相互作用(PPI)网络和miRNA mRNA网络，以探索与疾病进展相关的候选基因。Cox回归分析探讨ESCC患者生存时间与候选基因或miRNAs的相关性。ESCC 数据集的生物信息学分析示意图如图1所示。本发明探讨了ESCC的转录组表达模式，识别具有预后价值的新的生物标记物可以更好地了解ESCC的进展。

发明内容

本发明的技术方案如下：

MMP12蛋白作为生物标记物在制备食管癌新辅助放化疗疗效评估试剂、试剂盒或检测装置中的应用。

本发明提供了一种食管癌新辅助放化疗疗效评估的生物标记。在本发明中，术前新放化疗(nCRT)是治疗局部晚期食管癌的标准方法。然而，对于许多患者，nCRT的结果是不同的。在整合PPI网络和miRNA mRNA 网络后，我们筛选出8个与疾病进展相关的候选基因，包括肿瘤坏死因子、AKR1C1、AKR1C2、ICAM1、GPR68、 GNB4、SERPINE1和MMP12。此外，MMP12的异常表达水平与食管鳞癌的TNM分期、淋巴结转移、生存时间显著相关(P0.05)，本发明通过微阵列数据分析确定了预测食管鳞癌患者nCRT反应的新生物标记物，MMP12 可能是ESCC患者有用的肿瘤生物标志物和治疗靶点。

检测MMP12蛋白表达的产品在食管癌新辅助放化疗疗效评估中的应用。

一种食管癌新辅助放化疗疗效检测试剂盒，包括与MMP12蛋白特异性结合的检测物。

所述检测物优选自与MTHFD2蛋白特异性结合的抗体或者与MTHFD2编码基因特异性结合的引物或探针。