[发明专利]一种基于级联并行卷积网络的磁共振图像重建方法有效
申请号: | 202010792387.4 | 申请日: | 2020-08-09 |
公开(公告)号: | CN111951344B | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 段继忠;贾伟 | 申请(专利权)人: | 昆明理工大学 |
主分类号: | G06T11/00 | 分类号: | G06T11/00;A61B5/055;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 昆明明润知识产权代理事务所(普通合伙) 53215 | 代理人: | 马海红 |
地址: | 650093 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 级联 并行 卷积 网络 磁共振 图像 重建 方法 | ||
1.一种基于级联并行卷积网络的磁共振图像重建方法,其特征在于:包括如下步骤:
第一步,构建脑部数据集并进行数据预处理:
选取全采样的脑部图像数据集并进行归一化处理,数据集分为100个训练数据集和8个测试数据集,对训练数据集和测试数据集进行傅里叶变换得到k空间数据,在不同加速因子下用高斯欠采样伪影对k空间数据欠采样得到欠采样数据,然后逆傅里叶变换得到零填充图像数据;
第二步,通过深度学习框架PyTorch搭建基于Cascaded PCK-Net的磁共振图像的重建网络,基于Cascaded PCK-Net的磁共振图像的重建网络包括二个部分,并行卷积网络PCK-Net和数据一致性DC模块:
(1)PCK-Net:此网络的编码器和解码器由重复的模块组成:
在编码器端,基本模块由3×3卷积、并行卷积运算、1×1卷积和2×2最大池化运算组成,最大池化运算的下采样步长为2,并行卷积运算PCO包含两条路径:一条路径包含三个3×3卷积和一个1×1卷积;另一条路径包含两个3×3卷积和一个1×1卷积,将两条路径的输出连接起来,然后进行1×1卷积,所有卷积后均跟随一个激活函数ReLU;
在解码器端,基本模块由一个上采样的特征图和对应级别的1×1卷积输出的复制的特征图连接起来、3×3卷积、PCO、“Global shortcut”、PCO的输出和1×1卷积组成,上采样方法使用Upsample函数代替传统的Deconv函数,另外,“Global shortcut”连接编码器和解码器的相应级别,以防止过拟合;
(2)DC模块:表示数据一致性层,将PCK-Net输出的图像进行傅里叶变换得到k空间数据,与原始的欠采样k空间数据合并,得到新的k空间数据,再对该新的k空间数据进行傅里叶逆变换后得到重构图像,DC模块的目的是将图像进行保真处理,公式如下:
其中,表示待重构的2D图像数据堆叠为N点的列向量,m和n是图像的长和宽,N=m×n表示图像所有像素点数,表示欠采样的k空间数据,是傅里叶变换矩阵,F-1是逆傅里叶变换,表示欠采样矩阵,PT是P的转置,I是单位矩阵,λ为正则化参数,用于平衡正则化项和保真项,fDL是由θ参数化的深度学习网络的前向映射,包括数百万个可调整的网络权重,其中θ是网络权重参数,网络接收零填充图像xu作为输入,并生成重建结果作为输出;
第三步,模型训练:
把训练数据集输入到基于Cascaded PCK-Net的磁共振图像的重建网络中,通过正向传播得到高质量的脑部图像,根据高质量的脑部图像和全采样脑部图像的误差进行反向传播,不断更新网络权重参数直至误差不再减小,将训练好的网络权重参数保存为模型;
参数设置:目标函数使用逐像素平方误差,由于Cascaded PCK-Net模型需要耗费大量的显存,因此在实验中使用batch_size=1来训练网络,这并不会影响模型的收敛性,使用Xavier初始化权重,用Adam优化器训练整个模型,α=5×10-4,表示学习率,β1=0.9,表示第一次估计的指数衰减率,β2=0.999,表示第二次估计的指数衰减率,l2参数权重衰减为1×10-7,将训练好的网络权重参数保存为模型;
第四步,输入欠采样的测试数据集,加载第三步训练好的模型,输出重建的高质量脑部图像。
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