[发明专利]一种粪便样品总DNA提取方法在审
申请号: | 202010792905.2 | 申请日: | 2020-08-07 |
公开(公告)号: | CN111808846A | 公开(公告)日: | 2020-10-23 |
发明(设计)人: | 覃俊杰 | 申请(专利权)人: | 深圳谱元科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 深圳市精英专利事务所 44242 | 代理人: | 李莹 |
地址: | 518000 广东省深圳市龙华区观湖*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 粪便 样品 dna 提取 方法 | ||
1.一种粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,对粪便样品预处理,收集样品中的菌体;
S2,对菌体进行物理破碎;
S3,将破碎后的样品反复冻融2-5次之后,进行酶解处理;
S4,将酶解后的样品离心,取上清液,向其中加入0.6-1.5倍上清液体积的异丙醇进行沉淀处理;
S5,将沉淀后的样品离心,收集沉淀,对沉淀溶解之后进行DNA过柱纯化,即得到粪便样品总DNA。
2.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,所述步骤S1的具体操作为,
取180~200mg的粪便样品于离心管中,加入1000ul buffer PM,混匀成悬浮液,离心分离,去上清,收集到样品中的菌体。
3.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,所述步骤S2的具体操作为,
向菌体中加入玻璃珠、900ul Lysis buffer I,混匀后用组织破碎仪破碎处理。
4.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,所述步骤S3中,冻融的具体操作为:
将装有样品的离心管置于浮漂中,将浮漂用液氮冻5min后于室温下放3-4s,再放入65℃水浴5min,重复2-5次。
5.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,所述步骤S3中,进行酶解处理的具体操作为,
向冻融结束后的样品中加入20ul Lysis Enzyme I,37℃温育20min;
再加入225ul 20%SDS及10ul Lysis Enzyme II,56℃温育30min,再65℃温育30min。
6.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,所述步骤S4的具体操作为,
将酶解后的样品离心,取上清液,先加入等体积的Tris饱和酚溶液混匀;
再次离心分离,取上清液,加入0.6-1.5倍上清液体积的预冷的异丙醇,混匀,于-20℃下沉淀25-35min。
7.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,所述步骤S5的具体操作为,
将沉淀后的样品离心分离,去上清,向沉淀中加入100uL 0.1×buffer PM、500uLBinding Buffer及5uL NaAc,震荡至沉淀溶解,得DNA溶液;
对DNA溶液离心分离,取上清液转移至DNA吸附柱中,静置后将DNA吸附柱离心,弃滤液;
向DNA吸附柱中加入Washing Buffer,离心洗涤两次,除去吸附膜上残存的洗涤液;
将DNA吸附柱置于新的离心管中,打开管盖静置3-5min;
向DNA吸附柱中加入60uL经预热至55℃的Elution Buffer,离心分离,得到的滤出液为含DNA的保存液,即得到粪便样品总DNA。
8.如权利要求7所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,还包括将含DNA的保存液于-20℃保藏。
9.如权利要求1所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,步骤S1之前,还包括对粪便样品的采集:
在22-26℃或4℃及以下的温度条件下,常规物流运输采集的粪便样品,并在3天内到达实验室进行处理。
10.如权利要求9所述的粪便样品总DNA提取方法,其特征在于,对采集来的粪便样品,立即放于-20℃~-80℃保存。
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