[发明专利]一种批量蛋白质印迹膜条倾斜矫正和分割方法及系统有效
申请号: | 202010794867.4 | 申请日: | 2020-08-10 |
公开(公告)号: | CN112070678B | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 朱志亮;李泽寰;罗国亮;肖美华;涂文 | 申请(专利权)人: | 华东交通大学 |
主分类号: | G06T3/60 | 分类号: | G06T3/60;G06T7/12;G06T7/13;G06T7/155;G06T7/168;G06T7/194 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 赵秀斌 |
地址: | 330000 江西省南*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 批量 蛋白质 印迹 倾斜 矫正 分割 方法 系统 | ||
本发明公开了一种批量蛋白质印迹膜条倾斜矫正和分割方法及系统,其中,方法包括以下步骤:S1:获取含有多个蛋白质印迹膜条的图像,并对图像进行分割;S2:获取分割后的图像中每个蛋白质印迹膜条的倾斜角度,并根据倾斜角度对各自对应的蛋白质印迹膜条进行矫正,获得初步倾斜矫正图像;S3:对初步倾斜矫正图像进行预处理;S4:提取预处理图像中每个蛋白质印迹膜条的多个印迹区域,并进行定位;S5:分别将每个蛋白质印迹膜条对应的多个印迹区域进行重组,获得多个重组的蛋白质印迹膜条,输出矫正结果以及矫正结果中每个蛋白质印迹膜条对应的印迹区域的位置坐标。能够避免因膜条本身的空间弯曲导致的倾斜矫正不准确的不足,提升矫正的准确度。
技术领域
本发明涉及蛋白质印迹膜条矫正技术领域,尤其涉及一种批量蛋白质印迹膜条倾斜矫正和分割方法及系统。
背景技术
蛋白质印迹膜条,即打印在膜条上的条状蛋白质印记图。“印迹”或“电印迹”是指在电场影响下,用于将生物样品从凝胶转移到膜上的方法。该方法需要可固定生物分子样品用于随后检测的膜。这对于膜的表面积、孔隙和蛋白结合能力均提出了特殊要求。蛋白质印迹是对该技术的一种修饰,其包括在使用单克隆或多克隆抗体检测前,将蛋白质在膜上固定。在蛋白质固定到膜上之前,使用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)将样品蛋白分离为天然或变性的蛋白。所述蛋白随后转移或电印迹至膜上,进而采用对靶蛋白特异性的抗体对它们进行探测并最终检测。
蛋白质印迹法属于经验依赖性的多步骤方法,结果的优劣受到多个因素的影响,传统的手工操作容易引入误差,难以保证重复性和准确性,且试验后的蛋白质印迹膜条的处理也较难以人工精确完成,因此,蛋白质印迹膜条识别处理与图像处理技术相结合将是未来的必然趋势。计算机图像处理所拥有的准确性、高效性是人眼识别所无法比拟的。采用图像处理的方法来对蛋白质印迹膜条的结果进行分析的一个重要步骤就是对膜条进行倾斜矫正,倾斜矫正的准确性影响着后续蛋白质印迹膜条的分析的准确性。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是针对上述现有技术的不足,一种批量蛋白质印迹膜条倾斜矫正和分割方法及系统,能准确、鲁棒的矫正蛋白质印迹膜条,能批量矫正多个膜条,矫正效率高。
本发明解决上述技术问题的技术方案如下:一种批量蛋白质印迹膜条倾斜矫正和分割方法,包括以下步骤:
S1:获取含有多个蛋白质印迹膜条的图像,并对所述图像进行分割,获得分割后的图像;
S2:获取所述分割后的图像中每个蛋白质印迹膜条的倾斜角度,并根据所述倾斜角度对各自对应的蛋白质印迹膜条进行矫正,获得初步倾斜矫正图像;
S3:对所述初步倾斜矫正图像进行预处理,获得预处理图像;
S4:提取所述预处理图像中每个蛋白质印迹膜条的多个印迹区域和所述多个印迹区域之间的背景区域,并进行定位;
S5:分别将每个蛋白质印迹膜条对应的多个印迹区域和多个背景区域进行重组,获得多个重组的蛋白质印迹膜条,输出矫正结果以及所述矫正结果中每个蛋白质印迹膜条对应的印迹区域的位置坐标。
本发明的有益效果是,对含有多个蛋白质印迹膜条的图像进行分割可以将批量的蛋白质印迹膜条中的每一个膜条单独地提取出来,便于后续的分析;根据所述倾斜角度对各自对应的蛋白质印迹膜条进行初步矫正,批量处理多个蛋白质印迹膜条,增大矫正效率,最后基于重组策略对蛋白质印迹膜条进行倾斜矫正,能够避免因膜条本身的空间弯曲导致的倾斜矫正不准确的不足,进一步提升矫正的准确度,能更加准确、鲁棒的对膜条进行倾斜矫正。
进一步,所述S1中对所述含有多个蛋白质印迹膜条的图像分割的具体过程包括:
S101:采用Canny算子对所述含有多个蛋白质印迹膜条的图像进行边缘检测;
S102:对边缘检测结果的图像中,每个蛋白质印迹膜条进行线段检测和提取,获得每个所述蛋白质印迹膜条内部包含的直线;
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