[发明专利]一种基于galaxy的生信分析paas云平台系统在审
申请号: | 202010795840.7 | 申请日: | 2020-08-10 |
公开(公告)号: | CN111666356A | 公开(公告)日: | 2020-09-15 |
发明(设计)人: | 朱旨昂;阚苏立;吕兴祥;卢清瑶;孙祥;王婷 | 申请(专利权)人: | 南京江北新区生物医药公共服务平台有限公司 |
主分类号: | G06F16/28 | 分类号: | G06F16/28;G06F16/2453;G06F16/25;G06F16/2458;G06F16/23;G06F9/50 |
代理公司: | 北京卓岚智财知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11624 | 代理人: | 蒋真 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区新锦湖*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 galaxy 分析 paas 平台 系统 | ||
本发明涉及生信分析技术领域,具体地说,涉及一种基于galaxy的生信分析paas云平台系统。包括Web服务单元、数据存储单元、集群管理单元、数据格式转换单元和数据分析单元,所述Web服务单元用于用户注册、认证和页面展示;所述数据存储单元用于将生物信息录入数据库内;所述集群管理单元用于实现集群状态监控和资源调度;所述数据格式转换单元用于实现数据格式的转化;所述数据分析单元用于对生物信息进行分析。本发明设计能够提高数据处理效率,保障数据库内生物信息的完整性,为分析提供准确的数据支撑,加速数据分析过程,促进了生物医学研究的发展。
技术领域
本发明涉及生信分析技术领域,具体地说,涉及一种基于galaxy的生信分析paas云平台系统。
背景技术
随着高通量测序等各种组学技术的发展,生物医学研究大数据处理和分析的需求愈发迫切,由于,生物信息分析中数据量大,数据处理速度慢,影响数据处理效果,同时,平台内的数据库信息无法及时更新,在进行分析时,无法需现有的最新数据进行对比,影响数据分析效果。
发明内容
本发明的目的在于提供一种基于galaxy的生信分析paas云平台系统,以解决上述背景技术中提出的问题。
为实现上述技术问题的解决,本发明的目的之一在于,提供一种基于galaxy的生信分析paas云平台系统,包括Web服务单元、数据存储单元、集群管理单元、数据格式转换单元和数据分析单元,所述Web服务单元用于用户注册、认证和页面展示;所述数据存储单元用于将生物信息录入数据库内;所述集群管理单元用于实现集群状态监控和资源调度;所述数据格式转换单元用于实现数据格式的转化;所述数据分析单元用于对生物信息进行分析。
作为本技术方案的进一步改进,所述Web服务单元包括用户认证模块、权限管理模块和角色定义模块;所述用户认证模块用于认证用户信息;所述权限管理模块用于为用户设定权限;所述角色定义模块用于认证用户角色。
所述用户认证模块基于MySQL中建立用户信息表,其创建步骤如下:
①、确定用户信息字段,用户信息只有一些常用的、比较重要的信息,由于需要邮件验证,所以还需要保存临时验证码;
②、建立用户表,其函数代码如下:
create table user(
id int(10) unsigned not null auto_increment,
uid varchar(20) not null default '',
password varchar(30) not null default '',
realName varchar(20) not null default '',
gender tinyint(1) unsigned not null default '0',
email varchar(50) not null default '',
tel varchar(15) default null,
question varchar(50) default null,
validateCode varchar(20) not null default '',
answer varchar(50) not null default '',
loginNum int(10) unsigned not null default '0',
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