[发明专利]一种合成On-DNA二氢噻唑/噻唑化合物的方法有效

专利信息
申请号: 202010804505.9 申请日: 2020-08-13
公开(公告)号: CN112830950B 公开(公告)日: 2023-03-28
发明(设计)人: 李进;江思齐;何窦;高森;宋超;刘观赛;万金桥 申请(专利权)人: 成都先导药物开发股份有限公司
主分类号: C07H21/04 分类号: C07H21/04;C07H1/00;C40B40/06;C40B50/08
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 610200 四川省成都市双*** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 一种 合成 on dna 噻唑 化合物 方法
【说明书】:

发明涉及一种合成On‑DNA二氢噻唑/噻唑化合物的方法,该方法以On‑DNA氰基化合物为原料,与半胱氨酸及其衍生物反应得到On‑DNA二氢噻唑化合物,On‑DNA二氢噻唑化合物可进一步通过氧化可以得到On‑DNA噻唑化合物。该方法无需催化剂,不引入金属类试剂,操作简单,环境友好,适合使用多孔板进行的DNA编码化合物库的合成。

技术领域

本发明属于编码化合物库技术领域,具体涉及一种由On-DNA氰基化合物与半胱氨酸及其衍生物反应得到On-DNA二氢噻唑化合物,以及再进一步氧化得到On-DNA噻唑化合物的方法。

背景技术

在药物研发,尤其是新药研发中,针对生物靶标的高通量筛选是快速获得先导化合物的主要手段之一。然而,基于单个分子的传统高通量筛选所需时间长、设备投入巨大、库化合物数量有限(数百万),且化合物库的建成需要数十年的积累,限制了先导化合物的发现效率与可能性。近年来出现的DNA编码化合物库技术(WO2005058479、WO2018166532、CN103882532),结合了组合化学和分子生物学技术,在分子水平上将每个化合物加上一个DNA标签,并能在极短的时间内合成高达亿级的化合物库,成为下一代化合物库筛选技术的趋势,并开始在制药行业广泛应用,产生了诸多积极的效果(Accounts of ChemicalResearch,2014,47,1247-1255)。

DNA编码化合物库通过组合化学快速产生巨型化合物库,并且能高通量地筛选出先导化合物,使得先导化合物的筛选变得前所未有的快捷和高效。构建DNA编码化合物库的挑战之一就是需要在DNA上高收率地合成具有化学多样性的小分子。由于DNA需要在一定的条件下(溶剂、pH、温度、离子浓度)才能维持稳定,同时应用于DNA编码化合物库构建的On-DNA反应还需要有较高的产率。因此DNA上进行的化学反应(简称On-DNA反应)的试剂种类、反应种类、反应条件直接影响到DNA编码化合物库的丰富度和可选择性。从而开发能够与DNA兼容的化学反应也成为目前DNA编码化合物库技术的长期探索和研究方向,也直接影响了DNA编码化合物库的应用及商业价值。

二氢噻唑/噻唑类化合物是一类重要的药物骨架化合物,将二氢噻唑/噻唑骨架引入到DNA编码化合物库中能进一步扩展化合物库的多样性,有利于提高筛选到有效化合物的概率。目前已有报道的在DNA编码化合物库中构建噻唑骨架的方法是以On-DNA硫脲化合物为原料进行,适用的底物范围限制较大,且仅能合成胺基取代的On-DNA噻唑化合物。因此需要开发一种新的能广泛应用的On-DNA二氢噻唑/噻唑化合物合成方法,并适用于构建DNA编码化合物库的大批量多孔板操作。

发明内容

为了解决上述问题,我们开发了一种原料稳定存储、反应条件温和,底物普适性好,对DNA损伤小,适合于使用多孔板进行批量操作的DNA编码化合物库的合成方法,可以快速将On-DNA氰基化合物库通过一步反应转化为On-DNA二氢噻唑化合物,在氧化剂存在下,进一步将On-DNA二氢噻唑化合物转化得到On-DNA噻唑化合物。

本发明采用的技术方案如下:

本发明提供了一种合成On-DNA二氢噻唑/噻唑化合物的方法,所述On-DNA二氢噻唑化合物是以On-DNA氰基化合物为原料,与半胱氨酸及其衍生物反应后得到;所述On-DNA噻唑化合物是以On-DNA二氢噻唑化合物为原料,在氧化剂存在下反应得到;所述On-DNA氰基化合物的结构式为DNA-R-CN;所述半胱氨酸及其衍生物的结构式为

其中,结构式中DNA包含由人工修饰的和/或未修饰的核苷酸单体聚合得到的单链或双链的核苷酸链,该核苷酸链通过一个或多个化学键或基团与化合物中剩余部分相连;所述单链或双链的核苷酸链的长度为5~200bp。

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