[发明专利]一种与大白菜花色相关的分子标记及其应用

说明书

本发明涉及与大白菜花色相关的分子标记及其应用，公开了一个大白菜橘红色花基因Br‑or显著相关的SNP位点及用于检测该基因的KASP分子标记，通过BSA‑seq(bulked segregant analysis sequencing)方法检测到与橘红色花基因Br‑or显著相关的SNP位点Br‑or‑A09‑37676461(T/C)，该位点位于Br‑or启动子区域，A09染色体37,676,461位置。针对此SNP位点开发了KASP标记Br‑or‑KASP1，可用于大白菜橘红色花基因Br‑or的辅助选择。本发明还公开了该分子标记对应的引物序列及利用KASP技术检测该标记的流程。该分子标记可以高效率、低成本应用于大白菜橘红色花和橘红色叶球心的分子标记辅助育种，大大提高了抗病育种效率。

技术领域

本发明涉及作物分子标记辅助育种技术领域，具体涉及一种大白菜橘红色花基因Br-or的高通量检测标记及其在育种中的应用。

背景技术

花色是植物适应环境的表型性状之一。花色一般指花瓣的颜色，可作为虫媒植物引诱昆虫进行授粉的一个重要视觉信号，对植物生存繁衍具有重要意义。花色可以影响蚜虫取食，生产中选育不同花色的作物品种具有降低蚜虫传病的作用，也可以维持花瓣的能量平衡，避免花器官受伤害。花色在植物品种选育以及生长发育方面均有一定的影响，在提高种子纯度、去除杂株、鉴定天然异交率和检验种间性状转移等方面也有重要的作用。对于观赏性植物来说，花色不仅决定植物的观赏价值，也直接影响着其商业价值。

大白菜(Brassica rapa L.ssppekinensis)是我国栽培面积最大的蔬菜作物之一，在我国蔬菜作物中占有重要地位，其花色主要有黄色花、桔红色花和白色花。大白菜的花色可以作为其育种的标示性状用以早期淘汰不需要的材料，以加快育种选育进度。大白菜橘红色花性状是由1对隐性基因控制的质量性状，并且橘红色花和球心色性状完全连锁，即花色为橘红色的其球色也为橘红色，在转育过程中根据花色就能筛选到橘红心材料(张德双等，2003，大白菜花色和球色遗传规律的研究，华北农学报，18(2)：81-84.)。开发与橘红色花连锁的分子标记，不仅可以用于大白菜橘红色花的分子标记辅助育种，而且可以用于大白菜橘红心的分子育种，具有重要的应用价值。