[发明专利]一种巢式等温扩增结合基因编辑检测COVID-19病毒的试剂盒及方法在审
申请号: | 202010811763.X | 申请日: | 2020-08-13 |
公开(公告)号: | CN112111602A | 公开(公告)日: | 2020-12-22 |
发明(设计)人: | 聂志超;张鸿;李西清;张慧 | 申请(专利权)人: | 安徽微分基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6848;C12Q1/6804;C12R1/93 |
代理公司: | 安徽申策知识产权代理事务所(普通合伙) 34178 | 代理人: | 程艳梅 |
地址: | 238000 安徽省巢湖市巢湖经济开*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 等温 扩增 结合 基因 编辑 检测 covid 19 病毒 试剂盒 方法 | ||
1.一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括:
(1)巢式恒温扩增体系:RAA重组酶、反应缓冲液V、醋酸镁溶液、无核酸水和巢式RAA扩增结合COVID-19病毒引物组。
(2)基于基因编辑的核酸检测体系:Cas13a核酸酶、导向RNA、非特异性报告分子、检测缓冲液C。
(3)可视化检测系统:横向流动试纸条、检测层析液。
2.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述巢式恒温扩增体系的RAA重组酶被制作成干粉并分装到八连管中。
3.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述RAA重组酶包括细菌重组酶UvsX、辅助因子UvsY、DNA聚合酶、单链DNA结合蛋白和dNTPs。
4.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述巢式恒温扩增体系的反应缓冲液V包括30-50mM的Tris PH7.9、50-70mM的醋酸钾、5-10mM的乙酸镁、0.6-1.2mM的DTT、1.8-2.9mM的ATP、10-18mM的磷酸肌酸、60-90ng/ul的肌酸激酶和质量浓度为4-6%的聚乙二醇。
5.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述醋酸镁溶液的摩尔浓度为100-300mM。
6.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述Cas13a核酸酶选择细菌蛋白表达系统进行纯化。
7.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述导向RNA包含Cas13a核酸酶识别序列和靶向病毒RNA的互补序列。
8.根据权利要求7所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述导向RNA序列为:
(1)5-‘GAAATTAATACGACTCACTATAGGGGATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACAGGGTCCACCAAACGTAATGCGGGGTGC-3’
(2)5’-GAAATTAATACGACTCACTATAGGGGATTTAGACTACCCCAAAAACGAAGGGGACTAAAACTAGCAGGATTGCGGGTGCCAATGTGATC-3’。
9.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述非特异性报告分子序列为:
/56-FAM/mArArUrGrGrCmAmArArUrGrGrCmA/3Bio/,其中5’端用FAM标记,3’端用生物素标记。
10.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述检测缓冲液C包含1-3U T7 DNA聚合酶、8-12mM rNTPs和2-4mM的氯化镁。
11.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述横向流动试纸条的前端包被有带FAM抗体的纳米金粒,检测线上包被有生物素抗体,质控线上包被有固定抗体。
12.根据权利要求1所述的一种巢式等温扩增结合基因编辑COVID-19病毒试剂盒,其特征在于:所述检测层析液为无核酸的纯净水。
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