[发明专利]鱼类信息的获取方法、装置、电子设备及可读存储介质在审
申请号: | 202010814315.5 | 申请日: | 2020-08-13 |
公开(公告)号: | CN111949849A | 公开(公告)日: | 2020-11-17 |
发明(设计)人: | 胡嘉欣;何德奎;冯秀;隋晓云;朱仁 | 申请(专利权)人: | 中国科学院水生生物研究所 |
主分类号: | G06F16/951 | 分类号: | G06F16/951;G06F16/955 |
代理公司: | 北京众达德权知识产权代理有限公司 11570 | 代理人: | 张晓冬 |
地址: | 430072*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鱼类 信息 获取 方法 装置 电子设备 可读 存储 介质 | ||
本发明实施例公开了一种鱼类信息的获取方法、装置、电子设备及可读存储介质,本发明实施例中,获取多个国家的鱼类物种名录文件,得到鱼类物种名录数据库;根据鱼类物种名录数据库中的物种名信息编写目标网站的URL;根据URL在目标网站中爬取对应的网页信息,得到物种信息数据库;解析物种信息数据库中网页信息,得到物种信息数据库内容;基于物种信息数据库内容,根据物种信息数据库内容中的流域信息,确定特定流域物种名录;基于特定流域物种名录中的物种名,批量提取与物种名的相对应的鱼类信息。该方法可以根据鱼类信息的获取装置批量提取鱼类信息,将有关人员从大量机械重复的操作中解放出来,大大提高了工作效率。
技术领域
本发明涉及生物信息技术领域,具体涉及一种鱼类信息的获取方法、装置、电子设备及可读存储介质。
背景技术
世界鱼类数据库(FishBase)是一个提供鱼类所有种类和亚种的相关信息的全球数据库。该数据库中不仅有全球鱼类物种,还囊括了鱼类形态信息,生态数据以及分布数据等等。FishBase在信息获得和提取上仍有一些不足,譬如,FishBase只支持按国家划分以此获得国家鱼类物种名录,并不支持针对于特定流域的鱼类物种名录的获取。
鱼类目录数据库(Catalog of fishes,Cas)也是一个提供全球鱼类相关信息的全球数据库。相对于FishBase,其分类信息较为完善,但是囊括的数据量远远不如FishBase,仅仅包含了物种名的历史变更信息、现存物种名以及分布数据。
全球生物多样性信息网络(Global Biodiversity Information Facility,GBIF)数据库中包含了文献中所上传的所有物种详细样点的坐标信息,并且GBIF数据库与美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库关联,因此能够获得更为完善的信息。由于这三个数据库各有优劣,因此,人们在使用的过程中,通常会结合这三个数据库依次获取相对完整的信息。
流域鱼类物种信息的获取,是进行鱼类研究的前提条件,但现有方法对于特定流域物种名录的获取,需要得到流域所经国家全部的物种名录,然后人工依次从公开数据库进行一一核对,这种方法费时费力,工作效率很低。
发明内容
本发明实施例提供一种鱼类信息的获取方法、装置、电子设备及可读存储介质,可以提高工作效率。
第一方面,本发明实施例提供了一种鱼类信息的获取方法,包括:
获取目标流域;
确定所述目标流域流经的多个国家;
获取多个所述国家的鱼类物种名录文件,得到鱼类物种名录数据库;
根据所述鱼类物种名录数据库中的物种名信息编写目标网站的URL,所述目标网站包括FishBase网站和Cas网站;
根据所述URL在所述目标网站中爬取对应的网页信息,得到物种信息数据库;
解析所述物种信息数据库所述中网页信息,得到物种信息数据库内容,所述物种信息数据库内容包括物种的流域信息以及物种的基本信息,所述物种的基本信息包括物种形态数据、物种习性数据、物种分布数据以及物种名历史变更数据;
基于所述物种信息数据库内容,根据所述物种信息数据库内容中的流域信息,确定特定流域物种名录;
基于所述特定流域物种名录中的物种名,提取与所述物种名的相对应的鱼类信息,所述鱼类信息包括物种的基本信息和地理位置信息。
在一些实施方式中,所述根据所述鱼类物种名录数据库中的物种名信息编写目标网站的URL,包括:
根据所述鱼类物种名录数据库中的物种名信息编写所述FishBase网站的第一URL,所述第一URL与get请求相对应;
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