[发明专利]用于鉴定普通小麦品种的SNP分子标记以及SNP分子标记检测方法

说明书

本发明涉及农业分子检测领域，具体涉及用于小麦品种鉴定的SNP分子标记组合以及SNP分子标记检测方法。本发明的96个SNP位点组合在我国1463份审定小麦品种中共检出192个等位变异，对小麦品种具有较高的分辨率，96个SNP引物及其引物组合均能稳定、重复、特异性扩增，便于推广应用。

技术领域

本发明涉及农业分子检测领域，具体涉及用于鉴定普通小麦品种的SNP分子标记以及SNP分子标记检测方法。

背景技术

小麦是我国种植范围最广，消费面最宽，涉及三农面最大的粮食作物。我国是世界上最大的小麦生产国和消费国，对国际小麦市场具有举足轻重的影响。近年来，品种未审先推、制售假劣种子及套牌侵权等违法行为较为突出，造成了种子市场的混乱，严重影响了我国种业健康持续稳定发展，损害了育种家的权益和农民的利益。这些行为的发生，归根结底还是品种真实性鉴定问题。因此，制定小麦品种真实性分子快速鉴定规范是国家急需的技术。

品种真实性是将送验样品与其对应品种名称的标准样品比较，鉴定送检样品与标准样品是否相符。品种真实性鉴定，过去采用形态法(小区种植鉴定)、蛋白质电泳方法等，由于区分能力十分有限，特别是随着育种技术的进步，品种间差异越来越小，这些方法已完全不能满足准确、快速鉴定的需要。目前品种区分国际上主要推行SSR、SNP两种分子标记检测技术。近几年国内外的实践证明，SNP分子标记检测方法具有简单、经济、高效、检测周期短、数据可共享等优点，具有结果准确、规模化和自动化程度高的优势，是解决种子质量鉴定的有效手段，能够为种子市场监管提供有效的技术支撑，保障种子监管工作依法顺利开展。由于SNP标记技术经过10余年的发展，目前技术和平台已经较为成熟，具备普遍推行的条件。因此，制定小麦品种真实性SNP分子标记检测技术规范，从源头上保证品种的种子质量，发挥品种的应有作用，对于保证国家粮食安全，维护小麦种业健康持续稳定发展具有非常重要的现实意义。

发明内容

本发明的目的是提供96个小麦SNP分子标记的应用。

本发明的再一目的是提供鉴定小麦品种的SNP分子标记检测方法。

根据本发明的具体实施方式，提供了以下SNP位点组合用于鉴定小麦品种的应用，其中，所述SNP位点选自包括SNP位点WSNP01～SNP位点WSNP96的组合。

根据本发明的具体实施方式，通过对比待测样品与国家小麦审定标准样品的上述96个SNP位点检测结果，从而确定待测样品是否为真实的审定品种。

本发明筛选确定了96个SNP位点组合，所述96个SNP位点的物理位置是基于小麦品种中国春的全基因组序列比对确定的，所述小麦品种中国春全基因组序列的版本号为IWGSC RefSeqv1.0，所述96个SNP位点编号是WSNP01-WSNP96。

本发明提供了96个SNP位点组合可以形成用于鉴定小麦品种真实性、小麦分子育种或辅助小麦品种特异性鉴定。

本发明的再一目的在于提供了进行小麦品种真实性鉴定的方法。

根据本发明具体实施方式，用于普通小麦品种真实性鉴定的96个SNP位点编号、SNP所在的染色体、具体物理位置(参照中国春全基因组序列，版本号为IWGSCRefSeqv1.0)、脱氧核苷酸信息如下：

WSNP01位于1A染色体上第27215962位，其脱氧核苷酸为A或G；

WSNP02位于1A染色体上第41817136位，其脱氧核苷酸为T或C；

WSNP03位于1A染色体上第495285832位，其脱氧核苷酸为T或G；

WSNP04位于1B染色体上第587992062位，其脱氧核苷酸为T或C；

WSNP05位于1B染色体上第340381039位，其脱氧核苷酸为T或C；