[发明专利]一种用于阿尔茨海默病早期筛查的SNP位点组合、引物组及试剂盒

说明书

本发明提供了一种用于阿尔茨海默病早期筛查的SNP位点组合、引物组及试剂盒，属于阿尔茨海默病基因诊断技术领域。本发明所述用于阿尔茨海默病早期筛查的SNP位点组合共包括46个SNP位点，所述试剂盒包括针对上述46个SNP位点的多重PCR扩增引物组和单碱基延伸引物组；所述SNP位点组合、引物组及试剂盒能够对家族性和散发性阿尔茨海默病进行早期筛查和快速诊断。所述试剂盒检测相对简便，可多通道同时进行，通量高，一次性完成对46个基因突变位点的检测；所述试剂盒能够从认知障碍人群中早期筛选出家族性和散发性阿尔茨海默病所致认知障碍的患者，是后续精准治疗的基础。

技术领域

本发明属于阿尔茨海默病基因诊断技术领域，尤其涉及一种用于阿尔茨海默病早期筛查的SNP位点组合、引物组及试剂盒。

背景技术

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease，AD)是一种进行性神经退行性疾病，是老年人痴呆的最常见原因，给患者、家属和社会带来巨大的情感和经济负担。从痴呆人群中早期筛选出AD患者是后续治疗的基础。AD的主要病理标志物为β淀粉样蛋白(Aβ)沉积于神经元外形成的老年斑和磷酸化tau(p-tau)沉积于神经元内导致的神经原纤维缠结。然而在AD患者生前很难进行脑组织活检，脑脊液或PET检测Aβ和p-tau的有创性或昂贵费用又限制了其推广，因此大脑中异常表达的特征性生物学标记很难推广用于AD的早期预警和诊断。

基因诊断是精准医学的基础组成成分之一，分析基因组信息来评估患病风险及早期诊断患者具有重要的前瞻性意义。截止目前，多个研究报道了单核苷酸多态性(singlenucleotide polymorphism，SNP)与AD易感的相关性。全基因组关联研究(genome-wideassociation studies，GWAS)已经确定了40多个与AD相关的基因位点，它们对AD风险具有很强的累积作用。由于采集外周血损伤小、易于操作、花费低，因此应用基因组测序技术从外周血中寻找具有较高特异性和敏感性的遗传学标记物是目前AD早期预警和诊断的生物学标记物研究的主要方向之一。

目前，AD基因诊断的临床应用主要见于家族性AD。家族性AD的主要致病基因为编码淀粉样蛋白前体蛋白的APP基因及编码早老素PSEN1或2基因等的基因突变。但家族性AD仅占AD的5％～10％，而另外90％以上的散发性AD的风险基因的筛查则尚未进行临床推广。研究报道了载脂蛋白E(APOE)ε4等位基因是散发性AD发病的最重要遗传危险因素，与Aβ和p-tau的异常沉积有关。桥接整合子1(BIN1)基因的SNP是散发性AD的第二高风险基因。此外，其他被报道AD的易感基因还有LRP1，TREM2和SLC24A4等。

易感基因与阿尔茨海默病的研究越来越多，但是目前尚无基因诊断试剂盒替代Aβ和p-tau的检测；目前还无法实现对AD(含家族性和散发性)的早期筛查和快速诊断。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种用于阿尔茨海默病早期筛查的SNP位点组合、引物组及试剂盒；所述SNP位点组合、引物组及试剂盒能够对家族性和散发性阿尔茨海默病进行早期筛查和快速诊断。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一种用于阿尔茨海默病早期筛查的SNP位点组合，包括以下SNP位点：

表1 SNP位点

本发明提供了一种用于阿尔茨海默病早期筛查的引物组，包括多重PCR扩增引物组和单碱基扩增引物组；所述多重PCR扩增引物组包括SEQ ID No.1～SEQ ID No.92所示的核苷酸序列；所述单碱基扩增引物组包括SEQ ID No.93～SEQ ID No.138所示的核苷酸序列；

所述多重PCR扩增引物组用于对权利要求1中所述的SNP位点进行多重PCR扩增；