[发明专利]鹿茸产量性状的SNP标记、检测引物对、试剂盒及应用有效

专利信息
申请号: 202010847848.3 申请日: 2020-08-21
公开(公告)号: CN111793700B 公开(公告)日: 2023-06-30
发明(设计)人: 胡鹏飞;巴恒星;邓永砚;李春义 申请(专利权)人: 长春科技学院
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B20/20;G16B30/10
代理公司: 成都时誉知识产权代理事务所(普通合伙) 51250 代理人: 沈成金
地址: 130000 吉林*** 国省代码: 吉林;22
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摘要:
搜索关键词: 鹿茸 产量 性状 snp 标记 检测 引物 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.SNP标记在检测鹿茸产量性状中的应用,其特征在于:包括如下五个SNP标记位点的至少3个,其中,五个SNP标记位点分别为S 1 、S 2 、S 3 、S 4 与S 5 ;

所述的S 1 为表示该SNP位点位于马鹿基因组8号染色体的11137347bp处,该处核苷酸序列为C/T;

所述的S 2 为表示该SNP位点位于马鹿基因组8号染色体的28438186bp处,该处核苷酸序列为A/G;

所述的S 3 为表示该SNP位点位于马鹿基因组14号染色体的20928571bp处,该处核苷酸序列为A/G;

所述的S 4 为表示该SNP位点位于马鹿基因组15号染色体的86027207bp处,该处核苷酸序列为A/T;

所述的S 5 为表示该SNP位点位于马鹿基因组23号染色体的69698130bp处,该处核苷酸序列为C/G。

2.根据权利要求1所述的SNP标记在检测鹿茸产量性状中的应用,其特征在于:所述的五个SNP标记位点以马鹿基因组以及梅花鹿基因组进行系统分析得到的。

3.根据权利要求2所述的SNP标记在检测鹿茸产量性状中的应用,其特征在于:所述的系统分析为,包括以下步骤:

S1以同个鹿茸生长期内产量差异为参照,结合马鹿基因组以及梅花鹿基因组对比分析,获得初步的SNP标记位点;

S2对初步的SNP标记位点进行全基因组关联分析,筛分,得到与鹿茸产量相关的次级的SNP标记位点;

S3将次级的SNP标记位点进行基因注释和共表达网络分析,得到候选的SNP标记位点;

S4对候选的SNP标记位点通过MassARRAY技术分析,在相同鹿茸生长周期内的不同产量的梅花鹿个体中进行基因分型,得到不同的基因型;

S5对得到的基因型和鹿茸产量进行相关性分析,得到所述的五个SNP位点。

4.根据权利要求1所述的SNP标记在检测鹿茸产量性状中的应用,其特征在于:所述的五个SNP标记位点所在的DNA片段可由序列如SEQ ID NO.1~10所示的引物分别扩增得到。

5.鹿茸产量性状的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:

1)提取待检测梅花鹿或马鹿的基因组DNA;

2)以提取的基因组DNA为模板,利用SEQ ID NO:1~10所示的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物;

3)对扩增产物进行测序,分别检测马鹿基因组8号染色体的11137347bp与28438186bp处以及马鹿基因组14号染色体的20928571bp处、马鹿基因组15号染色体的86027207bp处、马鹿基因组23号染色体的69698130bp处的碱基,判定基因型;

4)根据判定的基因型,判断待检测鹿是否为鹿茸高产表型的优势个体。

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