[发明专利]用于检测甜瓜疫病抗性的CAPS标记及其应用有效
申请号: | 202010860895.1 | 申请日: | 2020-08-25 |
公开(公告)号: | CN111763764B | 公开(公告)日: | 2022-08-02 |
发明(设计)人: | 王平勇;徐志红;徐永阳;付楠;赵光伟;贺玉花;孔维虎;张健 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院郑州果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京动力号知识产权代理有限公司 11775 | 代理人: | 梁艳 |
地址: | 450009 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 甜瓜 疫病 抗性 caps 标记 及其 应用 | ||
1.检测与甜瓜抗疫病基因紧密连锁的CAPS标记的试剂在甜瓜抗疫病育种中的应用,所述CAPS标记位于甜瓜基因组3.5.1版本12号染色体第22,902,391bp的位置,表现为G/C多态性,所述CAPS标记以以下引物扩增获得:
上游引物序列:5’-TATGTAACTGCTATCTCCCTAA-3’;
下游引物序列:5’-GGTTACTGGAGCTTTGGCTC-3’;
将扩增产物以Fau I酶切判断多态性,酶切后形成一条220bp的条带和一条55bp的条带的为抗病材料,仅有275bp条带的为感病材料;
所述疫病指辣椒疫霉菌引起的,以叶、茎、果实处暗绿色、或黄褐色斑点为特征的甜瓜病害。
2.检测与甜瓜抗疫病基因紧密连锁的CAPS标记的试剂在与甜瓜抗疫病性状相关的甜瓜品种鉴定中的应用,所述CAPS标记以以下引物扩增获得:
上游引物序列:5’-TATGTAACTGCTATCTCCCTAA-3’;
下游引物序列:5’-GGTTACTGGAGCTTTGGCTC-3’;
将扩增产物以Fau I酶切判断多态性,酶切后形成一条220bp的条带和一条55bp的条带的为抗病材料,仅有275bp条带的为感病材料;
所述疫病指辣椒疫霉菌引起的,以叶、茎、果实处暗绿色、或黄褐色斑点为特征的甜瓜病害。
3. 根据权利要求1或2任一项所述的应用,其中PCR扩增体系为10μl,包括1μl DNA工作液,1μl 10×Buffer缓冲液,0.4μl dNTPs,0.2μl DNA聚合酶,上、下游引物各0.2μl,用7μlddH2O将总体积补齐至10μl;
扩增程序为:94℃预变性4min;94℃变性30s,55℃退火45s,72℃延伸1min,35个循环;72℃延伸8min;
酶切体系为:0.5μl限制性内切酶Fau I,1μl 10×CutSmart Buffer缓冲液,4μl PCR产物,4.5μl ddH2O将总体积补齐至10μl,55℃酶切4h,65℃灭活20min;
酶切后将酶切产物用7%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,硝酸银染色后观察。
4.一种甜瓜育种/品种鉴定用试剂盒,包括权利要求1所述的引物,
以及Fau I酶;
所述甜瓜育种为采用权利要求1所述的CAPS标记进行的甜瓜抗疫病育种;
所述品种鉴定为采用权利要求1所述的CAPS标记进行的与甜瓜抗疫病性状相关的甜瓜品种鉴定;所述疫病指辣椒疫霉菌引起的,以叶、茎、果实处暗绿色、或黄褐色斑点为特征的甜瓜病害。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其还包含PCR和酶切试剂。
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