[发明专利]一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法在审
申请号: | 202010877004.3 | 申请日: | 2020-08-27 |
公开(公告)号: | CN112071368A | 公开(公告)日: | 2020-12-11 |
发明(设计)人: | 王春平;曾占奎;王黎明;王征宏;庞玉辉 | 申请(专利权)人: | 河南科技大学 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B5/00;C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京中原华和知识产权代理有限责任公司 11019 | 代理人: | 贾双明;寿宁 |
地址: | 471000 河南*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 小麦 籽粒 聚糖 基因 定位 分子 标记 开发 方法 | ||
1.一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:包括以下步骤:
第一步:对小麦籽粒中果聚糖基因进行分子检测;第二步:构建遗传图谱,进行基因定位;第三步:计算果聚糖基因定位的结果;第四步:引物设计;第五步:对果聚糖含量基因的生物信息学分析。
2.根据权利要求1所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:步骤二中利用QTL Icimapping V4.1软件构建连锁图谱并进行遗传力的计算。
3.根据权利要求1或2所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:步骤二中采用完备区间作图法进行QTL定位,设置步移为1.0CM,P值临界值为0.001,LOD值为3,当LOD值大于3时则认为该基因分子处存在一个QTL。
4.根据权利要求1所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:通过利用步骤二中的定位方法在7B染色体上定位到一个主效位点QF.haust-7B。
5.根据权利要求1所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:以定位到的与QF.haust-7B紧密连锁的分子标记序列为模板,利用同源比对的方法在基因数据库中搜索同源性高的序列,对QF.haust-7B进行候选基因的筛选及功能预测,得到长度为11.47Mb的物理区间。
6.根据权利要求5所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:对QF.haust-7B进行候选基因的筛选及功能预测得到的物理区间内共包含103个基因。
7.根据权利要求6所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:通过对物理区间内的基因注释,筛选到10个与糖代谢相关的基因。
8.根据权利要求4或5所述的一种小麦籽粒中果聚糖基因定位及分子标记开发的方法,其特征在于:与定位到的QF.haust-7B紧密连锁的分子标记为SNP3026392和3934094。
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