[发明专利]一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码及其鉴别方法和应用

说明书

本发明提供了一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码及其鉴别方法和应用，属于分子生物学技术领域，本发明所述髭鲷未定种sp的DNA条形码序列如SEQ ID No.1所示；所述横带髭鲷的DNA条形码序列如SEQ ID No.2所示。扩增所述的DNA条形码的引物，包括F296和R515；所述方法包括以下步骤：提取待鉴别样本的基因组DNA；用所述的引物扩增所述的待鉴别DNA；将扩增产物的序列与DNA条形码进行比对；确定待鉴别样本的种类。利用本发明提供的DNA条形码鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷结果稳定，可重复性强。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，尤其涉及一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码及其鉴别方法和应用。

背景技术

髭鲷未定种sp发现于海南、浙江等近海水域，隶属于松鲷目(Lobotiformes)、髭鲷属(Hapalogenys)。其外部形态与横带髭鲷(Hapalogenys analis Richardson,1845)极为相似：背鳍I，XI-15～17；臀鳍III-9～10；胸鳍17；腹鳍I-5；尾鳍18～20，侧线鳞42-47。体呈椭圆形，高而侧扁；体长为体高1.6～2.1倍，为头长2.45～2.78倍；体背面较窄，腹面钝圆；尾柄短而侧扁，其长与高约相等。头中等大，由吻端至第一背鳍起点前坡度甚陡；头腹面较宽而平直，头长为吻长3.61～3.82倍，为眼径2.83～3.14倍。吻钝尖，其长约与眼径相等。眼中等大，侧上位，距吻端与距鳃孔距离上角相等。眼间隔微凸。鼻孔每侧2个，椭圆形，前鼻孔大于后鼻孔，周围有瓣膜，后缘瓣膜高呈三角形。口前位而低，稍斜，两颌等长，两颌牙细小呈带状，外行牙较大。颊部密生小髭，颏孔3对，最后一对长裂缝状。鳃孔大，前鳃盖骨后缘具细锯齿，鳃盖骨后缘有一小的扁平棘。假鳃明显。鳃耙6～8+12～14，钝短。体被细栉鳞。头部除吻端、两颌及额部外皆被鳞。上颌骨有鳞。背鳍、臀鳍基部有鳞鞘。侧线完全，位高，与背缘平行。背鳍棘部与鳍条部仅在基部相连，中间形成一深凹陷；背鳍鳍棘强大，在起点处有一向前倒棘，第二鳍棘最长且明显粗壮。臀鳍小，其起点与背鳍鳍条部相对。胸鳍小，末端圆形。腹鳍稍长于胸鳍，起点在胸鳍基底下方，其末端接近肛门。尾鳍圆形。体背部灰褐色，腹部较淡。体侧有4条黑色横带。髭鲷未定种sp为海南、浙江等近海水域少见鱼种。目前用于鉴定髭鲷未定种sp的方法还没有见正式报道。由于髭鲷未定种sp与横带髭鲷形态非常相似，二者仅在第二背鳍棘粗细及长短程度上存在较为明显的差别，仅凭借形态特征容易造成误鉴定。因此寻找区分髭鲷未定种sp和横带髭鲷的可靠标准，从混杂的个体中鉴别、分离样品成为一个重要问题。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码及其鉴别方法和应用；本发明采用微型DNA条形码将两种髭鲷进行鉴别，操作简单，易于掌握，准确性高；有助于解决种质混杂等问题，为种质保护及合理利用、鱼类分类学研究提供技术支撑。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一种鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的DNA条形码，所述髭鲷未定种sp的DNA条形码序列如SEQ ID No.1所示；所述横带髭鲷的DNA条形码序列如SEQ ID No.2所示。

本发明提供了扩增所述的DNA条形码的引物，包括F296和R515；所述F296的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；所述R515的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。

本发明提供了一种利用所述的DNA条形码鉴别髭鲷未定种sp与横带髭鲷的方法，包括以下步骤：

1)提取待鉴别样本的基因组DNA获得待鉴别DNA；

2)以步骤1)中获得的待鉴别DNA为模板，以所述的引物进行PCR扩增获得扩增产物；