[发明专利]一种肤质基因检测方法有效
申请号: | 202010886391.7 | 申请日: | 2020-08-28 |
公开(公告)号: | CN111944912B | 公开(公告)日: | 2021-11-16 |
发明(设计)人: | 黄娟;韩勋领;罗锋;谢海迎 | 申请(专利权)人: | 重庆浦洛通基因医学研究院有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869 |
代理公司: | 重庆坤源衡泰律师事务所 50255 | 代理人: | 张迅 |
地址: | 400711 重庆市北碚*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基因 检测 方法 | ||
1.一种肤质基因检测方法,其特征在于,包括人类皮肤抗氧化相关基因位点:GPX1基因上的rs1050450位点、SOD2基因上的rs4880位点、NQO1基因上的rs1800566位点、NFE2L2基因上的rs35652124位点,美白祛斑相关基因位点:基因间区上的rs1015362位点、HERC2基因上的rs12913832位点、基因间区上的rs4911414位点、SLC45A2基因上的rs16891982位点,抗糖化相关基因位点:AGER基因上的rs1800624、rs1800625位点,皮肤保湿相关基因位点:基因间区上的rs11103631位点、AQP3基因上的rs17553719位点、ZNF100基因上的rs10412066位点、OR10K2基因上的rs12239443位点,抗痤疮相关基因位点:DDB2基因上的rs1060573、rs747650位点、SELL基因上的rs7531806位点、TGFB2基因上的rs1159268位点,紫外线抵御相关基因位点:MC1R基因上的rs11648785位点、SLC45A2基因上的rs35391位点,抵御妊娠纹相关基因位点:基因间区上的rs7787362位点、SRPX基因上的rs35318931位点,皮肤抗衰老相关基因位点:WTAPP1基因上的rs1799750位点、基因间区上的rs322458位点,皮肤抗疤痕相关基因位点:NEDD4基因上的rs8032158位点、基因间区上的rs873549位点、基因间区上的rs1511412位点,清除污染相关基因位点:GSTP1基因上的rs1695位点、EPHX1基因上的rs1051740位点,抗皱纹相关基因位点:APOBEC1基因上的rs73064632位点、MTMR2基因上的rs566204位点、KRT40基因上的rs75202326位点、DLGAP1基因上的rs11876749位点,抗敏抗炎相关基因位点:RTEL1基因上的rs6010620位点、TMEM232基因上的rs7701890位点所有基因位点的检测;
所述基因位点的扩增引物对序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.70所示。
2.如权利要求1所述一种肤质基因检测方法,其特征在于:所述基因位点的扩增引物对中包含用于高通量测序的芯片接头序列,正向引物用于高通量测序的芯片接头序列为AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTTAAGGCGA,反向引物用于高通量测序的芯片接头序列为CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATTACCGAATGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATC。
3.如权利要求2所述一种肤质基因检测方法,其特征在于:所述扩增引物中同时包含用于序列分析时的index序列,一次拆分序列和二次拆分序列分别为TACCGAAT和TAAGGCGA。
4.如权利要求1所述一种肤质基因检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)取含有EDTA抗凝剂血液样本进行核酸提取;
2)预混35个所述基因位点对应的35对扩增引物;
3)将步骤1)得到的DNA和步骤2)预混好的引物混合液一起加入到多重PCR反应液里面,进行多重PCR扩增反应;
4)扩增产物利用产物纯化试剂盒进行纯化,完成测序文库制备;
5)将步骤4)制备完成的测序文库定量后进行高通量测序(NGS);
6)测序结束后,利用生物信息统计法,根据每个位点的引物进行拆分,得到每个位点对应的片段的扩增序列总条数,再统计出野生型纯合/杂合/突变纯合序列条数占对应位点扩增序列总条数的百分比,通过计算出的百分比进行基因分型判读。
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