[发明专利]皮肤光学相干层析成像图像中表皮层的自动识别方法有效
申请号: | 202010895236.1 | 申请日: | 2020-08-31 |
公开(公告)号: | CN112037242B | 公开(公告)日: | 2022-03-08 |
发明(设计)人: | 杨晨铭;李中梁;南楠;张茜;欧阳君怡;刘腾;步扬;王向朝 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海光学精密机械研究所 |
主分类号: | G06T7/13 | 分类号: | G06T7/13;G06T7/12;G06T7/187;G06T7/155;G06T7/00 |
代理公司: | 上海恒慧知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 31317 | 代理人: | 张宁展 |
地址: | 201800 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 皮肤 光学 相干 层析 成像 图像 中表 皮层 自动识别 方法 | ||
1.一种皮肤光学相干层析成像图像中表皮层的自动识别方法,其特征在于该方法包括以下步骤:
①使用OCT系统采集皮肤组织的干涉信号,并进行图像重建得到二维强度图像,对二维强度图像进行对数变换得到二维原始输入图像I,定义该图像第一行的第一个像素为原点,水平向右的横坐标x为横向扫描距离,竖直向下的纵坐标z为纵向成像深度,该二维原始输入图像I共有n列,n为正整数;
②对二维原始输入图像I进行基于高斯核的轴向求导,得到轴向梯度图Iz,取轴向梯度图Iz每一列最大值像素的纵坐标组成一个含有n个元素的一维数组z_surface,该数组元素为z_surface_1、z_surface_2,……,z_surface_m,……,z_surface_n,其中m为元素索引,是正整数;对于数组z_surface中与前一元素差值大于M的元素的索引m,在Iz的第m列以纵坐标为z_surface_(m-1)的像素点为中心,重新寻找在深度方向一定数量像素范围内的最大梯度位置,获得新的纵坐标z_surface_m(new),M的值可设为1到5;对于z_surface中与前一元素差值大于M的元素的索引均进行相同处理,得到新的一维数组z_surface_new;一维数组z_surface_new中n个元素的值认为是在二维原始输入图像I中的空气-表皮分界线上n个像素的纵坐标,n个元素的索引认为是空气-表皮分界线上n个像素的横坐标;
③在二维原始输入图像I中取出空气-表皮分界线上每个像素在竖直向上和向下方向连续的一定数量像素,保存在一个二维数组里,将此数组表示的图像记为Iroi,定义该图像第一行的第一个像素为原点,水平向右为横坐标x1,竖直向下为纵坐标z1;先对图像Iroi进行高斯滤波,再对每一列分别进行滑动窗口处理得到每一列的平均信号,记为一维数组avr;对每一列的avr进行一维线性滤波后,得到一个数组,将该数组中第一个极大值索引loc1后的最大值索引记为maxloc;对数组avr进行强度取反,即用255减去强度值,结果记为数组avr2;将数组avr2在索引loc1后的第一个极大值索引记为minloc,如果此第一个极大值为数组avr2在loc1和maxloc中间的最大值,则将索引minloc向上移动一定数量像素得到新的索引minloc;把每一列的minloc和maxloc分别组成一维数组min_loc和max_loc;对数组max_loc中元素分别与该数组所有元素平均值做差,将其中差值大于M2的元素的值改为图像Iroi的图像宽度;对于以Iroi图像纵坐标z1为基准的数组min_loc和max_loc元素,分别找到其对应的以二维原始输入图像I纵坐标z为基准的数组min_loc_real和max_loc_real元素;将二维原始输入图像I的每一列对应索引min_loc_real以上和索引max_loc_real以下的像素,其灰度值设置为0,其他像素的灰度值设置为1,得到模板图像Im;
④使用至少两个不同尺度的边缘检测算子,求得二维原始输入图像I的不同尺度梯度图,取某一尺度的梯度图为主要图像Ic,利用拓扑传递方法把主要图像Ic与其他尺度梯度图进行对比,以连接主要图像Ic的梯度不连续的边缘线,得到边缘线连续的梯度图It;将梯度图It乘以模板图像Im,得到表皮-真皮分界线大致位置的梯度图Itm;对原始输入图像I进行基于高斯核的轴向求导,得到轴向梯度图,并乘以模板图像Im,得到表皮-真皮分界线的大致位置的轴向梯度图Itzm;在梯度图Itm中,将与轴向梯度图Itzm每一列最大值坐标相同的像素设为1,并将这些点用直线连接;在梯度图Itm中将每一列对应空气-表皮分界线z_surface_new的像素设为1,并将这些点用直线连接,最终得到图像Itms;
⑤将图像Itms中坐标对应索引min_loc_real的像素设为起始点即种子填充的种子,根据四连通规则寻找第一个闭合区域,对该区域进行形态学闭运算,得到表皮层所在区域,再利用边界跟踪算子提取边缘,得到在二维原始输入图像上表皮层的边界线。
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