[发明专利]一种结肠癌转移预测方法和系统

说明书

本发明提供一种结肠癌转移预测方法和系统，通过蛋白质质谱检测技术，获取结直肠癌组织学石蜡切片的蛋白质信息，根据具体的蛋白信息纳入预测模型中，预测术后结肠癌的转移发生。

技术领域

本发明涉及蛋白质质谱检测应用于癌症预测技术领域，具体涉及一种结肠癌转移预测方法和系统。

背景技术

结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一。在西方发达国家，其发病率和死亡率位居肿瘤第3位，全球每年大约110万新发病例，53万死亡病例，其中我国每年新发病人数约40万人，发病数和死亡率已经超过美国。肝转移是结肠癌治疗失败、影响预后和长期生存的主要原因。结直肠癌具有显著的肝脏转移特异性，肝脏是结直肠癌最主要的转移部位，初次确诊的肠癌患者中，20％～40％存在肝转移，根治性切除术后5年内50％患者发生异时性肝转移，尸检报告见35％～81％发生肝转移。肝转移是结肠癌治疗失败、影响预后和长期生存的主要原因。

随着组学技术的发展，肿瘤转移发生、异质性成瘤等相关的基因、蛋白的信号转导途径和其内在分子群谱改变机制不断得到越来越详细的阐述，蛋白质组学研究已广泛应用于肿瘤生物学标记物的筛选和鉴定、肿瘤分类、治疗及肿瘤发生机制等方面。然而，目前临床尚缺少客观的分子标志物预测结直肠癌异时性肝转移的发生以及指导后续的治疗。

蛋白质标记物可以在常规术后的组织标本(例如石蜡切片标本)上轻易地测量，由此减少了对新鲜或冷冻组织活检的依赖。尽管有证据证明CRC组织蛋白质组相较正常结直肠组织发生明显变化，但到目前为止，并没有特异性预测CRC异时性肝转移以及术后复发的组学生物标志物被验证用于临床使用。在这种情况下，蛋白质组学作为一种理想的，高度可解析的研究工具，可用于寻找新的癌症生物标志物。

发明内容

本发明的目的是提供一种结肠癌转移预测方法及系统，用以提供针对结直肠癌患者肝脏异时性转移事件的预测。

为了达到上述目的，本发明一方面提供一种结肠癌转移预测方法，包括：

S1蛋白质提取，获取患者术中肿瘤组织的石蜡切片标本，进行脱蜡和再水化处理提取蛋白质样品；

S2酶解脱盐，将蛋白质样品进行胰酶消化和脱盐处理；

S3质谱分析，将经过步骤S2处理后的蛋白质样品进行质谱分析获得多肽质谱数据；

S4蛋白质信息定量分析与模型验证，将所述多肽质谱数据进行定量分析，挑选出蛋白标志物，将蛋白质标志物作为数据集构建结肠癌转移预测模型，基于所述模型的输出结果判断是否出现术后转移。

进一步的，在所述步骤S1中，还包括：

S101，剔除肿瘤周围间质组织；

S102，分别采用浓度为100％、67％和33％的二甲苯处理组织切片，并用浓度为100％、75％和50％的乙醇进行再水化处理；

S103，在99℃下温育30分钟加热变性，静置冷却至室温；

进一步的，在所述步骤S2中，还包括：

S201，将步骤S103中获取的蛋白质样品中加入typsin胰酶5ul(1ug/ul)，37℃恒温箱酶解过夜；

S202，将消化的肽脱盐、浓缩，然后重悬于含有0.1％FA的25％ACN中，然后通过使用高pH液相色谱分离消化的蛋白质样品。

进一步的，在步骤S3中，还包括：

S301，将经过步骤S205消化处理的蛋白质样品装载到质谱仪的捕获柱上进行洗脱肽处理；

S302，在高分辨率模式下以350至1500m/z测量扫描，然后以100至1250m/z在高灵敏度模式下进行质谱扫描；