[发明专利]基于Taqman-MGB实时荧光PCR技术的亚洲型舞毒蛾检测方法及其引物和探针有效

专利信息
申请号: 202010915616.7 申请日: 2020-09-03
公开(公告)号: CN111996263B 公开(公告)日: 2023-06-13
发明(设计)人: 吴志毅;程帆;任琰;李凯兵;田红伟;方文渊 申请(专利权)人: 浙江省检验检疫科学技术研究院;佛山海关综合技术中心(佛山国际旅行卫生保健中心;佛山海关口岸门诊部)
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 代理人: 沈渊琪
地址: 311215 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 基于 taqman mgb 实时 荧光 pcr 技术 亚洲 毒蛾 检测 方法 及其 引物 探针
【权利要求书】:

1. 基于Taqman-MGB实时荧光PCR技术的检测用引物探针组合,其特征在于所述引物包括上游引物LDND2-F和下游引物LDND2-R,所述LDND2-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述LDND2-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述探针为LDP,所述LDP的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,该探针的5’端以FAM报告荧光基团标记,3’端以MGB淬灭基团标记。

2.如权利要求1所述的引物探针组合在采用Taqman-MGB实时荧光PCR技术检测舞毒蛾中的应用,所述检测用于区分亚洲型舞毒蛾与毒蛾属其它昆虫。

3.基于Taqman-MGB实时荧光PCR技术的舞毒蛾检测方法,其特征在于,所述检测方法用于区分亚洲型舞毒蛾与毒蛾属其它昆虫;包括以下步骤:

(1)对不同地理种群的舞毒娥成虫的足进行DNA提取,对其中mtDNA部分基因的序列进行测序分析,选择突变率高的序列片段作为扩增的目的片段;

(2)设计特异性引物和探针,上游引物为LDND2-F,下游引物为LDND2-R,LDND2-F/LDND2-R的扩增产物长度为71bp,特异性探针为LDP,所述LDND2-F的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示,所述LDND2-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述LDP的核苷酸序列如SEQ IDNO.3所示,该探针的5’端以FAM报告荧光基团标记,3’端以MGB淬灭基团标记;

(3)进行实时荧光PCR扩增检测;

(4)建立标准曲线,以步骤(1)得到的DNA为标准品,进行10倍递减梯度稀释成5个浓度,每一浓度取2μL作为模板进行实时荧光定量PCR检测,以不同浓度的靶标DNA片段拷贝数的对数值作为横坐标,DNA相应的临界循环次数Ct值作为纵坐标,绘制标准曲线以进行相关性分析,用于舞毒蛾的定量快速检测分析。

4. 如权利要求3所述的基于Taqman-MGB实时荧光PCR技术的舞毒蛾检测方法,其特征在于所述步骤(3)和(4)中PCR扩增体系为20μL:2×TaqMan probe Real-time PCR MasterMixture 6μL,10μM上下游引物分别0.5μL,DNA模板2μL,10PM 的探针LDP0.8μL,加ddH2O至20μL。

5. 如权利要求3所述的基于Taqman-MGB实时荧光PCR技术的舞毒蛾检测方法,其特征在于所述步骤(3)和(4)中PCR扩增反应程序为:预变性95℃10min;然后95℃ 30sec,63℃30sec循环40次。

6.如权利要求3所述的基于Taqman-MGB实时荧光PCR技术的舞毒蛾检测方法,其特征在于所述步骤(4)中标准曲线关系式为Y=-2.85x+36.705,R2=0.9965。

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