[发明专利]一种用于肝细胞癌早期筛查的系统有效

专利信息
申请号: 202010927225.7 申请日: 2020-09-07
公开(公告)号: CN112063715B 公开(公告)日: 2021-09-14
发明(设计)人: 鲁志;朱昱敏 申请(专利权)人: 清华大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;G16H50/20;G16H50/80
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 闫书宁
地址: 100084 北京市海淀区1*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 肝细胞 早期 系统
【权利要求书】:

1.一种用于肝细胞癌早期筛查的系统,由检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的系统组成;根据血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量获得-△Ct,训练机器学习模型,获得随机森林的机器学习模型作为分类模型,从而实现肝细胞癌的早期筛查;

所述检测血浆中SNORD3B-1和hsa-circ-0080695相对表达量为采用荧光定量PCR方法检测血浆中SNORD3B-1和hsa-circ-0080695两个ncRNA相对外参的表达量;所述外参为ERCCSpike-in;

所述检测血浆中hsa-miR-122相对表达量为采用荧光定量PCR方法检测血浆中hsa-miR-122相对内参的表达量;所述内参为hsa-miR-1228-5p;

所述检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的系统包括检测SNORD3B-1的引物、检测hsa-circ-0080695的引物、检测ERCC Spike-in的引物、检测hsa-miR-122的引物和检测hsa-miR-1228-5p的引物;

检测SNORD3B-1的引物为5’-GAGAAGTTTCTCTGAACGTGTA-3’和5’-AATGGCTGACGGCAGTTG-3’;

检测hsa-circ-0080695的引物为5’-TGTGCGCCATAAGGAATTTCAA-3’和5’-ACTCCTCCTGGGTGAAATCCA-3’;

检测ERCC Spike-in的引物为5’-CAACGGTGCAATCTCAGCTA-3’和5’-CACGAGGATGTTCCTGTTGA-3’;

检测hsa-miR-122的引物为5’-GGCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTG-3’;

检测hsa-miR-1228-5p的引物为5’-ATATGTGGGCGGGGGCAGGTGTGTG-3’。

2.如权利要求1所述的系统,其特征在于:所述肝细胞癌为早期肝细胞癌;所述早期肝细胞癌为巴塞罗那0期肝细胞癌、巴塞罗那A期肝细胞癌、巴塞罗那B期或巴塞罗那C期肝细胞癌。

3.权利要求1或2所述的系统在制备用于肝细胞癌早期筛查的产品中的应用。

4.如权利要求3所述的应用,其特征在于:所述肝细胞癌为早期肝细胞癌;所述早期肝细胞癌为巴塞罗那0期肝细胞癌、巴塞罗那A期肝细胞癌、巴塞罗那B期或巴塞罗那C期肝细胞癌。

5.采用荧光定量PCR方法检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的物质在制备用于肝细胞癌早期筛查的产品中的应用;

所述检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的物质由检测SNORD3B-1的引物、检测hsa-circ-0080695的引物、检测ERCC Spike-in的引物、检测hsa-miR-122的引物和检测hsa-miR-1228-5p的引物组成;

检测SNORD3B-1的引物为5’-GAGAAGTTTCTCTGAACGTGTA-3’和5’-AATGGCTGACGGCAGTTG-3’;

检测hsa-circ-0080695的引物为5’-TGTGCGCCATAAGGAATTTCAA-3’和5’-ACTCCTCCTGGGTGAAATCCA-3’;

检测ERCC Spike-in的引物为5’-CAACGGTGCAATCTCAGCTA-3’和5’-CACGAGGATGTTCCTGTTGA-3’;

检测hsa-miR-122的引物为5’-GGCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTG-3’;

检测hsa-miR-1228-5p的引物为5’-ATATGTGGGCGGGGGCAGGTGTGTG-3’。

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