[发明专利]一种用于肝细胞癌早期筛查的系统有效
申请号: | 202010927225.7 | 申请日: | 2020-09-07 |
公开(公告)号: | CN112063715B | 公开(公告)日: | 2021-09-14 |
发明(设计)人: | 鲁志;朱昱敏 | 申请(专利权)人: | 清华大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16H50/20;G16H50/80 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 闫书宁 |
地址: | 100084 北京市海淀区1*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 肝细胞 早期 系统 | ||
1.一种用于肝细胞癌早期筛查的系统,由检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的系统组成;根据血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量获得-△Ct,训练机器学习模型,获得随机森林的机器学习模型作为分类模型,从而实现肝细胞癌的早期筛查;
所述检测血浆中SNORD3B-1和hsa-circ-0080695相对表达量为采用荧光定量PCR方法检测血浆中SNORD3B-1和hsa-circ-0080695两个ncRNA相对外参的表达量;所述外参为ERCCSpike-in;
所述检测血浆中hsa-miR-122相对表达量为采用荧光定量PCR方法检测血浆中hsa-miR-122相对内参的表达量;所述内参为hsa-miR-1228-5p;
所述检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的系统包括检测SNORD3B-1的引物、检测hsa-circ-0080695的引物、检测ERCC Spike-in的引物、检测hsa-miR-122的引物和检测hsa-miR-1228-5p的引物;
检测SNORD3B-1的引物为5’-GAGAAGTTTCTCTGAACGTGTA-3’和5’-AATGGCTGACGGCAGTTG-3’;
检测hsa-circ-0080695的引物为5’-TGTGCGCCATAAGGAATTTCAA-3’和5’-ACTCCTCCTGGGTGAAATCCA-3’;
检测ERCC Spike-in的引物为5’-CAACGGTGCAATCTCAGCTA-3’和5’-CACGAGGATGTTCCTGTTGA-3’;
检测hsa-miR-122的引物为5’-GGCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTG-3’;
检测hsa-miR-1228-5p的引物为5’-ATATGTGGGCGGGGGCAGGTGTGTG-3’。
2.如权利要求1所述的系统,其特征在于:所述肝细胞癌为早期肝细胞癌;所述早期肝细胞癌为巴塞罗那0期肝细胞癌、巴塞罗那A期肝细胞癌、巴塞罗那B期或巴塞罗那C期肝细胞癌。
3.权利要求1或2所述的系统在制备用于肝细胞癌早期筛查的产品中的应用。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于:所述肝细胞癌为早期肝细胞癌;所述早期肝细胞癌为巴塞罗那0期肝细胞癌、巴塞罗那A期肝细胞癌、巴塞罗那B期或巴塞罗那C期肝细胞癌。
5.采用荧光定量PCR方法检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的物质在制备用于肝细胞癌早期筛查的产品中的应用;
所述检测血浆中SNORD3B-1、hsa-circ-0080695和hsa-miR-122三个ncRNA相对表达量的物质由检测SNORD3B-1的引物、检测hsa-circ-0080695的引物、检测ERCC Spike-in的引物、检测hsa-miR-122的引物和检测hsa-miR-1228-5p的引物组成;
检测SNORD3B-1的引物为5’-GAGAAGTTTCTCTGAACGTGTA-3’和5’-AATGGCTGACGGCAGTTG-3’;
检测hsa-circ-0080695的引物为5’-TGTGCGCCATAAGGAATTTCAA-3’和5’-ACTCCTCCTGGGTGAAATCCA-3’;
检测ERCC Spike-in的引物为5’-CAACGGTGCAATCTCAGCTA-3’和5’-CACGAGGATGTTCCTGTTGA-3’;
检测hsa-miR-122的引物为5’-GGCTGGAGTGTGACAATGGTGTTTG-3’;
检测hsa-miR-1228-5p的引物为5’-ATATGTGGGCGGGGGCAGGTGTGTG-3’。
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