[发明专利]一种化学品发育毒性预测方法、预测模型及其构建方法与应用有效
申请号: | 202010933879.0 | 申请日: | 2020-09-08 |
公开(公告)号: | CN112063681B | 公开(公告)日: | 2023-07-14 |
发明(设计)人: | 程薇;王艳;冯艳 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学医学院 |
主分类号: | C12Q1/02 | 分类号: | C12Q1/02;C12N5/077;C12N5/0735;G16B40/00 |
代理公司: | 上海翼胜专利商标事务所(普通合伙) 31218 | 代理人: | 翟羽 |
地址: | 200025 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 化学品 发育 毒性 预测 方法 模型 及其 构建 应用 | ||
1.一种化学品发育毒性的预测方法,其特征在于,所述预测方法是以心肌细胞中α-Actinin和SOX17蛋白为指标,判断待测化学品的发育毒性;
所述预测方法包括:
设置待测组,包括待测组A和待测组B;所述待测组A是在第一浓度待测化学品的培养条件下,将人胚胎干细胞体外诱导分化成心肌细胞;所述待测组B是在第二浓度待测化学品的培养条件下,将人胚胎干细胞体外诱导分化成心肌细胞;所述人胚胎干细胞为hES细胞系H1;
设置所述待测组的对照组,所述待测组的对照组相比于所述待测组不添加待测化学品,且在该培养条件下将人胚胎干细胞体外诱导分化成心肌细胞;及
分别测定所述待测组及其对照组所获得的心肌细胞中的α-Actinin的阳性率及SOX17蛋白的阳性率,按照公式计算待测化学品的第一指标RCx及第二指标RC0,根据所述第一指标RCx及所述第二指标RC0判断待测化学品的发育毒性;其中,所述公式为:
RCx=(α-Actinin阳性率/SOX17阳性率)待测组A/(α-Actinin阳性率/SOX17阳性率)待测组的对照组;及
RC0=(α-Actinin阳性率/SOX17阳性率)待测组B/(α-Actinin阳性率/SOX17阳性率)待测组的对照组;
所述判断待测化学品的发育毒性是通过数学模型判断待测化学品的发育毒性;
所述数学模型为3个Fisher判别函数方程:
I)-25.943–5.880×log10RC0+29.713×log10RC25–36.441×log10(RC25–RC0);
II)-6.086+20.966×log10RC0+12.483×log10RC25–10.040×log10(RC25–RC0);及
III)-1.572+5.428×log10RC0+3.417×log10RC25–1.064×log10(RC25–RC0);
其中,所述第一浓度为所述待测化学品对人胚胎干细胞的细胞生长抑制率为25%时的浓度,所述第一指标RCx记为RC25;所述第二浓度为第一浓度的1/100;以及
所述判断的方法为:将待测化学品的第一指标RC25及第二指标RC0代入所述3个Fisher判别函数方程,若I>II且I>III,则判断待测化学品为无发育毒性;若II>I且II>III,则判断待测化学品为弱发育毒性;若III>I且III>II,则判断待测化学品为强发育毒性。
2.根据权利要求1所述的化学品发育毒性的预测方法,其特征在于,所述化学品为单质或化合物。
3.根据权利要求2所述的化学品发育毒性的预测方法,其特征在于,所述化学品为青霉素G、糖精钠、阿司匹林、地高辛、丙咪嗪、氯化锂、咖啡因、6-氨基烟酰胺、羟基脲、5-氟尿嘧啶、全反式维甲酸、多柔比星、赭曲霉素A、反应停或多菌灵。
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