[发明专利]一种基于人体条件致病菌的室内微生态环境宜居性检测方法在审
申请号: | 202010944455.4 | 申请日: | 2020-09-10 |
公开(公告)号: | CN114164260A | 公开(公告)日: | 2022-03-11 |
发明(设计)人: | 徐健;孙政;朱鹏飞;张丽丽;代娅婕 | 申请(专利权)人: | 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/06;C12Q1/04 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 李颖 |
地址: | 266101 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 人体 条件 致病菌 室内 生态环境 宜居性 检测 方法 | ||
1.一种基于人体条件致病菌的公共场所室内微生态环境宜居性检测方法,其特征在于:包括采集模块(1),检测模块(2)和计算模块(3)三个部分;
所述样品采集模块(1),收集待检测环境的菌群样品,并提取其DNA;
所述检测模块(2),以采集模块(1)所提供的样品DNA为原料,进行高通量测序完成菌群检测;
所述计算模块(3),利用检测模块(2)所获得的样品测序数据利用生物信息学手段对样品的菌群结构进行分析计算,得到室内微生态环境微生态指数MiBE,进而对待检测室内微生态环境的宜居性进行判断。
2.根据权利要求1所述的样品采集模块,其特征在于:利用环境取样拭子,在≥16cm2的室内表面范围内,蘸取缓冲液反复摩擦10-50次,获取室内环境菌群。
3.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:所述高通量测序为对对收集的样品进行扩增子测序,扩增区域为16S rDNA的保守区域,引物为27F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3';534R:5'-ATTACCGCGGCTGCTGG-3'。
4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:所述获得的样品测序数据以GreenGenes的16S rRNA全长序列数据库为依据,使用QIIME、Trimmomatic、FLASH、FastxToolkit和Parallel-Meta3中的一种或几种软件,对样品中所含细菌分类,进化分类中的菌属一层进行结构还原,最终获得样品中所含细菌的各个相对丰度值。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:利用分析样品的菌群结构数据,利用公式计算获得MiBE值
其中,N:待检测空间微生物群落中对人体健康有影响的细菌数量;P:微生物群落中与人类健康有关(致病菌)的i细菌的相对丰度;M:一个给定的微生物群落中的所有细菌的数量;X:i细菌的相对丰度;i为样品中某一种菌。
6.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:所述当MiBE超过0.15时,MiBE越高且微生物多样性指数越低,环境宜居性越差。揭示有可能存在致病风险,应当及时注意清理。
7.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于:所述待检测环境可为交通枢纽、医院、学校、体育场馆、商贸市场等公共场所。
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