[发明专利]基于迁移学习图像增强的低场强MR胃部分割方法有效
申请号: | 202010947917.8 | 申请日: | 2020-09-10 |
公开(公告)号: | CN112102276B | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 姚瑶;缑水平;刘豪锋;张晓鹏;刘宁涛;刘波;张向荣 | 申请(专利权)人: | 西安电子科技大学;杭州职业技术学院 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/194 |
代理公司: | 陕西电子工业专利中心 61205 | 代理人: | 侯琼;王品华 |
地址: | 710071*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 迁移 学习 图像 增强 场强 mr 胃部 分割 方法 | ||
1.一种基于迁移学习图像增强的低场强MR胃部分割方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)输入高场强3DMR胃部影像集Ahigh及待分割的低场强3DMR胃部影像集Alow,分别对其进行预处理,得到强度均匀的预处理后高场强3DMR胃部影像集X和预处理后待分割的低场强3DMR胃部影像集Y,且X与Y空间分辨率、大小及灰度区间保持一致;其中,X对应标签数据集XL,Y对应标签数据集YL;
(2)生成伪低场强3DMR胃部影像集:
将预处理后的高场强3DMR胃部影像集X与预处理后的待分割低场强3DMR胃部影像集Y输入循环生成式对抗网络CycleGAN中,学习影像集X和Y之间的映射关系,生成伪低场强3DMR胃部影像集对应标签数据集/
(3)构建训练集、验证集、测试集和迁移训练集:
在预处理后待分割的低场强3DMR胃部影像集Y中随机抽取60%作为训练集Train,对应标签数据集将剩余的40%影像随机等分为两部分,一部分为验证集Valid,对应标签数据集/另一部分为低场强3DMR胃部影像作为测试集Test,对应标签数据集/将伪低场强3DMR胃部影像集/作为迁移训练集Train1,对应标签数据集/
(4)构建3D Res3-U-Net分割网络N:
(4a)由归一化层BN+非线性激活层Relu+卷积层conv3×3×3构成第一卷积模块C1;由归一化层BN+非线性激活层Relu+卷积层conv1×1×1构成第二卷积模块C2;
(4b)将第一卷积模块C1和第二卷积模块C2按照C2+C1+C2的方式得到卷积操作模块C;
(4c)根据卷积操作模块C构建结构如下的3D Res3-U-Net分割网络N:
第一卷积层→第二卷积层→第一池化层→第三卷积层→第四卷积层→第二池化层→第五卷积层→第六卷积层→第三池化层→第七卷积层→第八卷积→第一上采样层→第九卷积层→第十卷积层→第二上采样层→第十一卷积层→第十二卷积层→第三上采样层→第十三卷积层→第十四卷积层→全连接层;
(5)使用训练集Train和验证集Valid,训练步骤(4)构建的3D Res3-U-Net分割网络N,得到最优3D Res3-U-Net分割网络Nbest;
(5a)令3D Res3-U-Net分割网络N训练及验证的迭代次数为e,且1≤e≤E;其中E表示设置的最大迭代次数,E∈[50,500];
(5b)初始化当前迭代次数,即令迭代次数e=1;初始化最优Dice相似系数,即令最优Dice相似系数Dbest=0;
(5c)使用训练集Train,训练第e次迭代的3D Res3-U-Net分割网络N,获取训练后3DRes3-U-Net分割网络Ne,及其对应的权重We和偏置be;
(5d)将验证集Valid样本记为其中Iv为验证集中的胃部影像,/为胃部影像Iv对应的标签;将Iv输入训练后3D Res3-U-Net分割网络Ne得到胃部影像Iv对应的输出Ov,获取输出Ov与标签/之间的Dice相似系数De;
(5e)将De与当前最优Dice相似系数Dbest进行比较,若De≥Dbest,则令训练后3D Res3-U-Net分割网络Ne为最优3D Res3-U-Net分割网络Nbest,并将当前最优Dice相似系数Dbest更新为De;
(5f)判断当前迭代次数e是否达到最大迭代次数E;若未达到,即e≠E,继续执行步骤(5g);反之,若e=E,则终止训练过程,得到最优3D Res3-U-Net分割网络Nbest,直接执行步骤(6):
(5g)对当前迭代次数e加1之后,返回步骤(5c);
(6)使用迁移训练集Train1,对最优3D Res3-U-Net分割网络Nbest进行迁移学习,得到迁移后最优3D Res3-U-Net分割网络N'best;
(6a)令最优3D Res3-U-Net分割网络Nbest训练迭代次数为h,且1≤h≤H,其中H表示设置的分割网络Nbest训练迭代最大次数,H∈[20,100];
(6b)初始化当前迭代次数,即令迭代次数h=1;
(6c)使用迁移训练集Train1,对最优3D Res3-U-Net分割网络Nbest进行第h次迭代训练;
(6d)判断当前迭代次数h是否达到最大迭代次数H;若未达到,即h≠H,继续执行步骤(6e);反之,若h=H,则终止训练过程,得迁移后最优3D Res3-U-Net分割网络N'best,直接执行步骤(7);
(6e)对当前迭代次数h加1之后,返回步骤(6c);
(7)利用迁移后最优3D Res3-U-Net分割网络N'best,获得测试集Test的胃部影像分割结果。
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