[发明专利]一种医学图像的心耳分割方法、装置及存储介质在审
申请号: | 202010948652.3 | 申请日: | 2020-09-10 |
公开(公告)号: | CN112070752A | 公开(公告)日: | 2020-12-11 |
发明(设计)人: | 高琪;方存亮;王哲;魏润杰 | 申请(专利权)人: | 杭州晟视科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/33;G06T3/40;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 林超 |
地址: | 311100 浙江省杭州市*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 医学 图像 心耳 分割 方法 装置 存储 介质 | ||
1.一种医学图像的心耳分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:对包含心脏区域的多组医学图像数据集中的原始医学图像进行预处理后得到原始图像数据集;
将每组医学图像数据重构得到三维模型,从三维模型中分离出心耳三维模型,根据心耳三维模型得到对应的三维二值矩阵,通过三维二值矩阵生成对应的心耳图像作为标签图像数据集;
S2:基于3D-Unet网络架构构建神经网络模型,神经网络模型包括输入层、前处理模块、后处理模块和输出层;
S3:将步骤S1的原始图像数据集和标签图像数据集输入神经网络进行训练,损失函数值采用均值Dice损失函数获得;
S4:根据步骤S3训练好的神经网络模型对单组待分割的医学图像数据进行心耳的识别和分割,输出一组心耳分割预测图像,完成医学图像的心耳分割。
2.根据权利要求1所述的一种医学图像的心耳分割方法,其特征在于,所述步骤S1中对包含心脏区域的医学图像进行预处理的方法具体为:
1.1)利用连续插值算法先对每组医学图像数据集中的医学图像进行重采样;
1.2)对每幅医学图像中所有非零像素进行合并,根据设定的裁剪值对合并后的图像进行裁剪;
1.3)通过三次B样条基函数作为变形函数对医学图像进行仿射变换;
1.4)最后对医学图像进行灰度阈值化处理。
3.根据权利要求1所述的一种医学图像的心耳分割方法,其特征在于,所述步骤S2构建的神经网络模型具体为:
输入层、前处理模块、后处理模块和输出层依次连接;
前处理模块包括五个依次连接的前处理子单元,第一个、第二个、第三个和第四个前处理子单元均包括依次连接的一个第一卷积块、两个第二卷积块和一个dropout层,第五个前处理子单元包括依次连接的一个第一卷积块、两个第二卷积块和一个上采样层;
后处理模块包括四个依次连接的后处理子单元,第一个后处理子单元、第二个后处理子单元和第三个后处理子单元包括依次连接的两个第二卷积块、一个第三卷积块和一个上采样层,第四个后处理子单元包括依次连接的一个第一卷积块和一个第三卷积块;
图像经输入层输入第一个前处理子单元,输出层主要由一个reshape层和一个激活函数层依次连接组成。
4.根据权利要求3所述的一种医学图像的心耳分割方法,其特征在于,
每个前处理子单元中第一卷积块的输出经逐像素求和操作均输入后一个前处理子单元的第一卷积块,其中,第五个前处理子单元中第一卷积块的输出输入第一个后处理子单元中第一个第二卷积块;第一个、第二个、第三个和第四个前处理子单元中第二个第二卷积块的输出经级联的操作分别输入第四个、第三个、第二个和第一个后处理子单元中第一个第二卷积块;
第二个后处理子单元的第三卷积块依次经第三卷积块和第一个upscale层的输出与第三个后处理子单元的第三卷积块经第三卷积块的输出逐像素求和后输入第二个upscale层,第二个upscale层的输出与第四个后处理子单元的输出逐像素求和后输入到输出层输出。
5.根据权利要求3所述的一种医学图像的心耳分割方法,其特征在于,
第一个前处理子单元和第四个后处理子单元的第一卷积块由步长为1的3*3*3的卷积层组成;第二个、第三个、第四个和第五个前处理子单元的第一卷积块主要由一个步长为2的3*3*3的卷积层、一个实例规范化层和一个激活函数层组成;
第二卷积块主要由一个步长为1的3*3*3的卷积层、一个实例规范化层和一个激活函数层组成;
第三卷积块主要由一个1*1*1的卷积层、一个实例规范化层和一个激活函数层组成。
6.根据权利要求3或5任一所述的一种医学图像的心耳分割方法,其特征在于,所述激活函数层采用Leaky ReLU激活函数计算。
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