[发明专利]快速检测生长速度快的翘嘴红鲌的方法及所用的分子标记

说明书

本发明公开了一种翘嘴红鲌快速生长相关的分子标记以及该分子标记对应的引物；本发明还同时公开了利用分子标记进行的快速检测生长速度快的翘嘴红鲌的方法：以待测翘嘴红鲌的DNA作为PCR扩增的模板，PCR扩增后，PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，对其进行测序：在440bP产生T/C转变，判定该翘嘴红鲌生长速度快；在440bP仍然为C，判定该翘嘴红鲌生长速度一般。

技术领域

本发明涉及快速检测翘嘴红鲌快速生长相关的分子标记及其用途。

背景技术

分子遗传标记是一种以DNA多态性为基础的遗传标记，可以反映出生物个体在DNA水平上的差异。它很普遍存在于所有的生物中而且数量非常丰富，不会受外界环境干扰影响。^.目前主要应用于水产动物的DNA标记技术有：限制性片段长度多态性标记(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、随机扩增多态性DNA(Randomamplified polymorphic DNA,RAPD)、简单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)、扩增片段长度多态性(Amplified fragmentlength polymorphism,RFLP)和单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNPs)等技术。

单核甘酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNPs)是人类和动物基因组中普遍存在的一种分子标记。主要是指在基因组水平上由单个核甘酸的变异所引起的DNA序列的多态性。它是可遗传的变异中一种最常见的变异。最早在1994年，Lander学者第一次提出SNP可以作为新一代分子标记，随后Wagner等便利用3241个SNPs标记成功构建了人类第一张SNPs遗传。SNP具有以下特点：数量多基因组覆盖率高，呈二态性且具有代表性、遗传稳定性强，易实现自动化分析。

关于SNP在水产动物遗传育种中的应用：近年来，国内外很多学者通过候选基因法发现与动物生长性状相关的SPNs位点的研究并且取得不错的成效。Trant JM等对芳香化酶(P450)基因与性别分化的关系进行了研究，证实芳香化酶与鱼类性别分化息息相关。Tao等采用PCR-RFLP技术对10个候选基因的SNPs筛选，结果发现部分SNPs位点与北极嘉鱼的早期生长速率存在明显的相关性。以上这些研究都都是候选基因法寻找与生长性状相关的SNP位点十分可行，且成效明显的有力证据。

随着生物科技的不断发展，SNP作为新一代分子标记，已被应用于各个物种中。SNP在构建高密度遗传连锁图谱的构建、群体遗传结构、关联性分析。系统发育分析、品种资源鉴定等方面均表现十分广阔的应用前景。

翘嘴红鲌(Erythrocul terilishaeformis)，隶属于鲤形目、鲤科、鲌亚科，体型较大，是大型淡水经济鱼类鳊鲌亚科中最大的一种鱼。其肉质鲜美，鳞下富含脂肪，在我国江浙沪市场价格比较高，且需求量大。开展翘嘴红鲌的品种选育工作，选育出具有较快生长速度的翘嘴红鲌品种，具有重要的现实意义。目前国内对翘嘴红鲌的研究主要存在养殖技术方面，其分子相关研究较少，分子育种被认为是最有效率的育种方法，现有的EST数据库数据有限，所以开展翘嘴红鲌生长性状相关功能基因克隆及SNP位点筛选的工作极为重要。

因此，建立一种快递灵敏、经济检测翘嘴红鲌优良生长性状的方法对开展翘嘴红鲌的品种选育具有重要意义。

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供一种可以简便快速筛选生长速度快的翘嘴红鲌的方法和所用分子标记，本发明首次利用DNA的多态性，通过PCR的方法，对翘嘴红鲌DNA进行快速检测验证。

为了解决上述技术问题，本发明提供一种翘嘴红鲌快速生长相关的分子标记，分子标记引物采用如下引物对，其中的核苷酸序列为5’-3’，

P4(F)：GGCAGACGGTTCTCATACAGC