[发明专利]与苏姜猪生产性状相关的MC4R基因分子标记及其制备方法和应用

说明书

本发明公开了与苏姜猪生产性状相关的MC4R基因分子标记，该分子标记的位点选自如下位点的至少一种：(1)猪参考基因组11.1版本1号染色体第160773885位碱基（rs335628164）由C到T的位点突变；(2)猪参考基因组11.1版本1号染色体第160773971位碱基（rs81221063）由A到T的位点突变；上述二个位点完全连锁。关联分析确定2个分子标记与苏姜猪生产性状呈显著相关，可以用于苏姜猪分子标记辅助选择育种中。

技术领域

本发明属于猪标记辅助选择(MAS)技术及遗传育种领域，涉及到可用于苏姜猪生产性状标记辅助选择的分子标记的制备与应用。

背景技术

受非洲猪瘟的影响，国内生猪存栏量不足，严重影响猪肉的供给，尤其是优质猪肉的供给。优质种猪则是优质猪肉的保障。传统的育种方法在生产性状等低遗传力性状上收效甚微。随着分子生物学技术的发展，遗传力低、表型值难以测定或测定费用高的性状可以通过分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)来提高猪育种选择效率和准确性。

黑素皮质素受体4(melanocortin 4 receptors，MC4R)是运输Leptin蛋白的载体，参与控制食欲、体重、能量代谢等生理过程，其主要功能是在维持能量的动态平衡的过程中进行信号传导。MC4R蛋白是Leptin调节采食量效应降低和刺激下丘脑神经原活性调控通路的下游物质，对调控能量平衡有着至关重要的作用。MC4R可与大脑组织释放的内源配体α-促黑激素(α-MSH)相互作用，促进体重的降低。已有相关文献报道背膘厚度性状与MC4R基因密切相关，猪MC4R基因第7跨膜结构功能域内具有一个高度的同源保守片段，当错义突变(G/A)发生时可造成Taq I酶切位点的变化，从而导致猪MC4R蛋白的第298位氨基酸由天冬氨酸变成天冬酰胺(Asp298Asn)，因此，Asp298Asn错义突变可适用于以西方猪种为杂交亲本的商品猪品种背膘厚的分子标记。苏姜猪是以姜曲海猪、枫泾猪为母本，杜洛克猪为父本，通过继代选育而成的新品种，肉质指标达到了优质猪肉的要求。开发与苏姜猪生产性状相关的MC4R基因分子标记并应用于优质苏姜猪的选育，对满足人们对优质猪肉的需求，加快我国优质种猪的培育具有重要的促进作用。

发明内容

发明目的：本发明的目的在于开发可应用于苏姜猪生产性状辅助选育的分子标记，加速生产性状遗传改良进程。

首先从影响猪生产性状的重要候选基因MC4R中鉴定出潜在的可影响苏姜猪生产性状的遗传变异位点，然后建立相应遗传变异位点的简便的分子标记检测方法，并对分子标记的应用效果在苏姜猪群中进行了验证，结果表明所开发的分子标记可应用于苏姜猪体重、体高和胸围中至少一种性状的分子标记辅助选育。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现：

一种与苏姜猪生产性状相关的MC4R基因分子标记，所述分子标记位于猪1号染色体上的MC4R基因的核苷酸序列上，所述分子标记的位点选自如下位点的至少一种：

(1)猪参考基因组11.1版本序列1号染色体序列第160773885位碱基(rs335628164)由C到T的位点突变，对应于SEQ ID NO:2所示序列中的第425位碱基处，同时对应于SEQ ID NO:1的第2473位碱基；

(2)猪参考基因组11.1版本1号染色体第160773971位碱基(rs81221063)由A到T的位点突变，对应于SEQ ID NO:2所示序列中的第511位碱基处，对应于SEQ ID NO:1所示序列中2559位碱基处。