[发明专利]一种基于G四链体分子信标双酶级联等温扩增的检测目的miRNA的方法有效
申请号: | 202010975612.8 | 申请日: | 2020-09-16 |
公开(公告)号: | CN112080552B | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 蒋宇扬;谭英;陈俊粤;谭春燕 | 申请(专利权)人: | 清华大学深圳国际研究生院 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/682 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 闫书宁 |
地址: | 518055 广东省深圳市南山区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 四链体 分子 信标 级联 等温 扩增 检测 目的 mirna 方法 | ||
1.一种检测目的miRNA的方法,包括如下步骤:
(1)取含有miRNA、反应缓冲液、DNA聚合酶、核酸外切酶和G4MB的反应体系,孵育;
(2)完成步骤(1)后,检测荧光强度;
根据荧光强度判断miRNA中是否含有目的miRNA或目的miRNA的含量;
G4MB从5’末端至3’末端依次包括DNA片段1、DNA片段2和DNA片段3;
DNA片段1由1个5’端磷酸化并修饰荧光基团的dT和富G序列1组成;富G序列1为GGGACGGG;
DNA片段2的核苷酸序列与miRNA的核苷酸序列反向互补;
DNA片段3由1个3’端修饰淬灭基团的dA和富G序列2组成;富G序列2为GTGGAGGG;
DNA片段1和DNA片段3由于都存在富G序列在分子内形成绑定的G四链体结构;
所述DNA聚合酶作用于与G4MB的3’末端结合的引物,将引物进行延伸,形成双链DNA;
所述核酸外切酶作用于双链DNA,逐步切去单核苷酸,且不能从DNA的切刻或缺口处起始消化;
G4MB的5’端具有磷酸基团,3’端具有引物结合位置,且以打开的G4MB为模板,通过引物和DNA聚合酶引发合成双链杂合结构;
所述DNA聚合酶为Bsu DNA聚合酶;
所述核酸外切酶为Lambda核酸外切酶;
所述方法用于非疾病的诊断与治疗。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:所述反应体系还含有核糖核酸酶抑制剂。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于:
所述反应缓冲液为含40-60mM NaCl、15-25mM MgCl2、15-25mM KCl、130-170mM NH4Cl和0.8-1.2mM DDT的pH7.8-8.0、15-25mM Tris-HCl缓冲液。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于:所述步骤(1)中,孵育为35-39℃孵育20min-3h。
5.如权利要求1至4任一所述的方法,其特征在于:当检测N个目的miRNA时,需要加入N个G4MB且各个G4MB的荧光标记完全不同;N为1以上的自然数。
6.DNA聚合酶、核酸外切酶、G4MB和反应缓冲液在检测目的miRNA中的应用;
G4MB从5’末端至3’末端依次包括DNA片段1、DNA片段2和DNA片段3;
DNA片段1由1个5’端磷酸化并修饰荧光基团的dT和富G序列1组成;富G序列1为GGGACGGG;
DNA片段2的核苷酸序列与miRNA的核苷酸序列反向互补;
DNA片段3由1个3’端修饰淬灭基团的dA和富G序列2组成;富G序列2为GTGGAGGG;
DNA片段1和DNA片段3由于都存在富G序列在分子内形成绑定的G四链体结构;
所述反应缓冲液为含40-60mM NaCl、15-25mM MgCl2、15-25mM KCl、130-170mM NH4Cl和0.8-1.2mM DDT的pH7.8-8.0、15-25mM Tris-HCl缓冲液;
G4MB的5’端具有磷酸基团,3’端具有引物结合位置,且以打开的G4MB为模板,通过引物和DNA聚合酶引发合成双链杂合结构;
所述DNA聚合酶为Bsu DNA聚合酶;
所述核酸外切酶为Lambda核酸外切酶;
所述应用用于非疾病的诊断与治疗。
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