[发明专利]一种LAMP法检测水产病原用内参质控引物组及其应用有效
申请号: | 202010976839.4 | 申请日: | 2020-09-17 |
公开(公告)号: | CN112011647B | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
发明(设计)人: | 葛辉;周宸;林琪;吴建绍 | 申请(专利权)人: | 福建省水产研究所(福建水产病害防治中心) |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6893;C12Q1/689;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/63 |
代理公司: | 山东三邦知识产权代理事务所(普通合伙) 37308 | 代理人: | 肖太升;高洋 |
地址: | 361012 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 lamp 检测 水产 病原 内参 引物 及其 应用 | ||
本发明公开了一种LAMP法检测水产病原用内参质控引物组及其应用,属于水产病原检测试剂开发技术领域。本发明LAMP法检测水产病原用内参质控引物组根据SEQ ID No:1所示核酸序列或与其互补的碱基序列或其转录的RNA序列设计。本发明的内参质控引物组可用于鱼类、虾类、蟹类、参类等多种水产动物病原的检测,为多种水产动物病原检测体系的构建奠定基础。
技术领域
本发明属于水产病原检测试剂开发技术领域,具体涉及一种LAMP法检测水产病原用内参质控引物组及其应用。
背景技术
我国是世界上重要的水产品生产和出口大国之一,水产养殖业是农业经济的主要支柱产业。近年来,随着水产养殖业的发展,养殖规模的不断扩大,水产养殖病害的发生日益频繁,危害越来越严重,是制约整个水产养殖业发展的最重要的因素之一。据不完全统计,2002-2009年,我国水产养殖病害平均年损失达百亿元之巨,其中鱼类约占55%~77%,甲壳类约占11%~28%,贝类约占3%~16%。因此,做好水产病害的预防工作是现代水产养殖业中的重中之重。
水产病原的快速诊断,对水产养殖的良种选育,疾病预防、进出口检疫、水产品食品安全等方面具有重大意义。目前常用的水产病害的检测技术主要包括:目检、镜检、病原的分离鉴定、聚合酶链式反应、核酸杂交、限制性酶切、基因芯片、酶联免疫检测技术、免疫荧光技术;这些检测方法均存在依赖精密仪器、检测成本高、灵敏性和特异性差,操作程序繁琐,难以推广等缺点;而且常规的病原检测技术大都不适合养殖基层的现场快速检测。
LAMP技术是一种新的DNA扩增方法,该技术依赖于自动循环的链置换反应,在等温条件下,不到1h就能扩增出109靶序列拷贝,具有特异、灵敏、快速、简便等特点,在水产病原检测上有较为广泛的应用前景。
由于LAMP反应易受检测试剂(例如反应酶失活)、扩增模板的核酸提取质量(例如提取的核酸被严重降解或因操作失误未将核酸提取出来)等因素的影响,因此,设置LAMP反应检测的内参质控显得尤为重要;目前,关于内参质控的报道多见于人类疾病检测,而关于水产病原检测的内参质控鲜有报道。而且现有的内参质控引物组多数只针对于同一种生物,适用于多种生物的内参质控引物组的报道较少。
发明内容
针对现有技术中存在的问题,本发明的目的是提供一种LAMP法检测水产病原用内参质控引物组及其应用,本发明的内参质控引物组可用于鱼类、虾类、蟹类、参类等多种水产动物病原的检测,为多种水产动物病原检测体系的构建奠定基础。
为了达到上述目的,本发明采用如下技术方案:
SEQ ID No:1所示核酸序列在设计LAMP法检测水产病原用内参质控引物组中的应用。
一种LAMP法检测水产病原用内参质控引物组,根据SEQ ID No:1所示核酸序列或与其互补的碱基序列或其转录的RNA序列设计。
在上述方案的基础上,所述LAMP法检测水产病原用内参质控引物组的序列为:
F3:5’-CGGGGAATCAGGGTTCGA-3’;
B3:5’-GTGGAGCTGGAATTACCGC-3’;
FIP:5’-TTCGTCACTACCTCCCCGTGCCTGAGAAACGGCTACCACAT-3’;
BIP:5’-CGAACGGGGCCTCGCAATTGACTTGCCCTCCACTCGA-3’;
LF:5’-CGGGAGTGGGTAATTTGCGC-3’;
LB:5’-ACACTTTAAATCCTTGTACGAGGA-3’;
或
F3:5’-TTCTTAGACCGTCGCATGAC-3’;
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