[发明专利]一种鉴定或辅助鉴定猪生长性状的方法及其相关SNP标记

说明书

本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定猪生长性状的方法及其相关SNP标记，基于猪10.2版参考基因组，检测待测猪的第10号染色体735574位基因型是CC/TC/TT中的哪一种。CC基因型猪是该位点为碱基C的纯合子；TT基因型猪是该位点为碱基T的纯合子；TC基因型猪是杂合子。在三种基因型猪中，TC基因型猪达100kg体重日龄显著小于TT型和CC型。同时，TC基因型猪眼肌面积显著大于TT型和CC型。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种鉴定或辅助鉴定猪生长性状的方法及其相关SNP标记。

背景技术

猪的生产性能是评价生猪养殖效率的重要因素之一，生产性能可细分为瘦肉率、脂肪含量、肉的品质和饲料利用率等多项指标。其中瘦肉率是一类非常重要的生产指标，与之相关的活体测量指标包括背膘厚度、眼肌面积和达100kg体重日龄等。对这些性状背后遗传机制的研究具有非常重要的经济价值和研究意义。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNPs)是一种广泛应用的生物学分子标记，常见于群体进化分析及全基因组关联分析，能够在单碱基精度上研究性状与位点变异的关系。对于不同遗传背景的猪，相同生长周期内影响体重的主要是自身遗传因素，但是，目前猪遗传育种领域多以肉质性状、繁殖性状和抗病性状为主要研究对象，缺少对生长性状关联基因和位点的研究，本专利发现的SNP位点可以填充这方面的空白。

发明内容

本发明所要解决的技术问题在于，如何提供一种鉴别或者辅助鉴别生长性状好的猪的方法。

本发明涉及检测SNP标记735574的多态性或基因型的物质在如下A1-A3中的应用；所述SNP标记735574为位于10.2版猪参考基因组的第10号染色体735574位核苷酸，其为C或T：

A1，在鉴定或辅助鉴定猪达100kg体重日龄中的应用；

A2，在鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积中的应用；

A3，在猪育种中的应用。

所述A3中的猪育种为培育猪达100kg体重日龄小和/或猪眼肌面积大的猪品种。

所述检测SNP标记735574的多态性或基因型的物质如下B1)或B2)或B3)：

B1)用于扩增含有SNP标记735574的DNA片段的成套引物；

B2)含有A1)的PCR试剂；

B3)含有A1)或A2)的试剂盒。

所述成套引物由序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成。

本发明还要求保护一种产品，所述产品为检测SNP标记735574的多态性或基因型的物质，具体为如下：下B1)或B2)或B3)：

B1)用于扩增含有SNP标记735574的DNA片段的成套引物；

B2)含有A1)的PCR试剂；

B3)含有A1)或A2)的试剂盒。

所述B1)中成套引物由序列表中序列2所示的单链DNA分子和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成。

一种鉴定或辅助鉴定猪眼肌面积大小的方法，所述方法包括：检测待测猪基因组中所述SNP标记735574的基因型，其中，CC基因型与TT基因型的猪的猪眼肌面积小于CT基因型的猪的猪眼肌面积，CC基因型与TT基因型的猪的猪眼肌面积差异不显著；

所述纯合CC基因型的猪为SNP标记735574位点均为C的猪；

所述杂合CT基因型的猪为SNP标记735574位点为C和T的猪；