[发明专利]ALS类除草剂胁迫下棒头草稳定表达的内参基因、筛选方法及应用有效
申请号: | 202010987149.9 | 申请日: | 2020-09-18 |
公开(公告)号: | CN112048511B | 公开(公告)日: | 2023-09-22 |
发明(设计)人: | 于晓玥;唐伟;陆永良;张建萍;杨永杰 | 申请(专利权)人: | 中国水稻研究所 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12Q1/6895;C12Q1/6851 |
代理公司: | 浙江千克知识产权代理有限公司 33246 | 代理人: | 裴金华 |
地址: | 311400 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | als 除草剂 胁迫 棒头 稳定 表达 内参 基因 筛选 方法 应用 | ||
1.一种ALS类除草剂胁迫下棒头草稳定表达的内参基因筛选方法,其特征在于,包括样品处理、提取RNA与制备cDNA、候选内参基因设计与分析,其中,候选内参基因设计与分析包括以下步骤:
(1)筛选5个候选内参基因,分别为UBQ、EF1、18srRNA、25srRNA、26srRNA,并设计上述候选内参基因的扩增引物;
(2)以所述cDNA作为扩增模板,利用PCR对所述扩增引物特异性进行测定;
(3)利用荧光定量PCR反应后得到的Ct值,对所述候选内参基因进行稳定性分析;
(4)利用Bestkeeper、NormFinder、geNorm分别计算分析所述内参基因在ALS类除草剂处理下的表达量稳定性。
2.根据权利要求1所述的一种ALS类除草剂胁迫下棒头草稳定表达的内参基因筛选方法,其特征在于,所述候选内参基因设计与分析的步骤(3)中荧光定量PCR反应体系包含:10μl iTaq universal SYBR Green Supermix (2x)、2μl cDNA 模板、上游或下游引物10μM各1μl、6μl 无菌超纯水;反应条件为:95°C预变性30s,95°C变性5s,60°C退火34s,40个循环。
3.根据权利要求1所述的一种ALS类除草剂胁迫下棒头草稳定表达的内参基因筛选方法,其特征在于,所述样品处理中的样品采集对象为:对ALS类除草剂表现3~4倍抗性水平的AR棒头草种群和对ALS类除草剂敏感的AS棒头草种群。
4.根据权利要求3所述的一种ALS类除草剂胁迫下棒头草稳定表达的内参基因筛选方法,其特征在于,所述样本处理包括:a.分别选择所述AR棒头草种群和AS棒头草种群两个种群中的种子进行分组播种,生长至3~4叶期后喷施浓度为4.0~5.0g.a.i/ha的ALS类除草剂;b.以喷施ALS类除草剂0h、24h、48h、72h为四次取样时间,取叶片并在液氮中速冻用于RNA提取。
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