[发明专利]基于CRISPR技术进行靶核酸多重检测的方法有效
申请号: | 202010987874.6 | 申请日: | 2020-09-18 |
公开(公告)号: | CN113293198B | 公开(公告)日: | 2022-12-02 |
发明(设计)人: | 段志强;陈莹 | 申请(专利权)人: | 山东舜丰生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12N9/22;C12N15/113 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 王正君;徐迅 |
地址: | 250101 山东省济南市高新*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 crispr 技术 进行 核酸 多重 检测 方法 | ||
1.一种检测样品中靶核酸的方法,所述方法为非疾病诊断目的的方法,所述方法包括将样品与核酸检测组合物和单链核酸检测器接触,所述核酸检测组合物包括Cas蛋白和gRNA;所述gRNA包括与所述Cas蛋白结合的区域和与靶核酸上的靶序列杂交的导向序列;其特征在于,所述方法包括将样品进行以下反应:
i、将样品与第一核酸检测组合物、第三核酸检测组合物和单链核酸检测器接触,在第一温度下反应第一时间段,然后在第三温度下再反应第三时间段;或者,
ii、将样品与第一核酸检测组合物、第三核酸检测组合物、第四核酸检测组合物和单链核酸检测器接触,在第一温度下反应第一时间段,之后在第三温度下再反应第三时间段,然后在第四温度下再反应第四时间段;
所述第一核酸检测组合物包括Cas12i、可以结合Cas12i以及与靶核酸上的第一靶序列杂交的第一gRNA;
所述第三核酸检测组合物包括Cas12j、可以结合Cas12j以及与靶核酸上的第三靶序列杂交的第三gRNA;
所述第四核酸检测组合物包括Cas12b、可以结合Cas12b以及与靶核酸上的第四靶序列杂交的第四gRNA;
所述第一温度为48℃;所述第三温度为52℃;所述第四温度为60℃;
检测由Cas蛋白切割单链核酸检测器产生的可检测信号,从而检测靶核酸。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述可检测信号通过以下方式进行检测:基于视觉的检测,基于荧光信号的检测,基于传感器的检测,荧光偏振,胶体相变/分散,电化学检测和基于半导体的检测。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述可检测信号通过以下方式进行检测:颜色检测。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述可检测信号通过以下方式进行检测:基于金纳米颗粒的检测。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶核酸包括核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述靶核酸包括单链核酸、双链核酸。
7.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述靶核酸包括单链 DNA、双链 DNA、单链RNA。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述靶核酸为病毒核酸、细菌核酸、与对照有差异的特异核酸。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述与对照有差异的特异核酸为特定的突变位点。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述病毒为植物病毒或动物病毒。
11.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述病毒为乳头瘤病毒,肝 DNA 病毒,疱疹病毒,腺病毒,痘病毒,细小病毒,冠状病毒。
12.根据权利要求11所述的方法,其特征在于,所述冠状病毒包括SARS、SARS-CoV2(COVID-19)、HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1、Mers-Cov。
13.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述单链核酸检测器的两端分别设置荧光基团和淬灭基团。
14.核酸检测组合物在制备检测样品中靶核酸的检测试剂盒中的用途;所述核酸检测组合物选自权利要求1中的第一核酸检测组合物和第三核酸检测组合物,或者,所述核酸检测组合物选自权利要求1中的第一核酸检测组合物、第三核酸检测组合物和第四核酸检测组合物;所述第一核酸检测组合物在权利要求1中所述的第一温度下与所述样品进行接触,所述第三核酸检测组合物在权利要求1中所述的第三温度下与所述样品进行接触,所述第四核酸检测组合物在权利要求1中所述的第四温度下与所述样品进行接触。
15.根据权利要求14所述的用途,其特征在于,所述检测试剂盒为适于不同温度下对样品进行多重检测的试剂盒;所述试剂盒包括所述第一核酸检测组合物和第三核酸检测组合物,或者,所述试剂盒包括所述第一核酸检测组合物、第三核酸检测组合物和第四核酸检测组合物。
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